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ello82
Nuovo Arrivato
Prov.: Milano
Città: Neviano
34 Messaggi |
 Inserito il - 20 giugno 2010 : 15:28:04
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Ciao a tutti! avrei un problema di statistica! allora sto eseguendo un esperimento mediante RQ-PCR. voglio sapere la quantità di un certo gene. per prima cosa creo la retta di taratura con concentrazioni nota di plasmidi e ottengo il numero di copie. ho così una retta a 5 punti. per i campioni incogniti nessun problema inserisco il numero di copie e ottengo la quantità di gene. il giorno successivo ripeto lo stesso esperimento: stessi plasmidi, ma con campioni differenti. Ora dato che ho delle rette di regressione molto simili voglio farne una sola che sia la media delle 2. per farlo mi conviene mediare il numero di copie o i coefficienti angolari?
grazie mille in anticipo!
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Life's too short to grieve in sorrow.Fate is waiting for your soul.Live your life like no tomorrow.Worth you're while until gone. By Angra |
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Glubus
Utente Junior
156 Messaggi |
Inserito il - 23 giugno 2010 : 08:03:15
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Per capire meglio: questa replicazione dell'esperimento la fai solo due volte?
GB
Citazione:
Messaggio inserito da ello82
Ciao a tutti! avrei un problema di statistica! allora sto eseguendo un esperimento mediante RQ-PCR. voglio sapere la quantità di un certo gene. per prima cosa creo la retta di taratura con concentrazioni nota di plasmidi e ottengo il numero di copie. ho così una retta a 5 punti. per i campioni incogniti nessun problema inserisco il numero di copie e ottengo la quantità di gene. il giorno successivo ripeto lo stesso esperimento: stessi plasmidi, ma con campioni differenti. Ora dato che ho delle rette di regressione molto simili voglio farne una sola che sia la media delle 2. per farlo mi conviene mediare il numero di copie o i coefficienti angolari?
grazie mille in anticipo!
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ello82
Nuovo Arrivato
Prov.: Milano
Città: Neviano
34 Messaggi |
Inserito il - 28 giugno 2010 : 14:57:03
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| no no la retta di regessione viene fatta da ogni tornata. mi spiego meglio. il giorno X di giugno mi arrivano 25 pazienti. per questi pazienti faccio la retta di regressione utilizzando i plasmidi e trovo la concentrazione dei miei 25 pazienti. Nel mese di luglio ritornano i 25 pazienti e ripeto lo stesso procedimento, ma questa volta la mia nuova retta di regressione la medio con quella del mese precedente e così per agosto. ammettiamo che a settembre mi arrivi un nuovo paziente. non sto a rifare la retta di regressione per un solo paziente, ma uso quella precedentemente mediata. quindi la robustezza dell'analisi miglioa col tempo, man manco che aumentano i valori da mediare. chiaro? |
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chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 28 giugno 2010 : 17:57:37
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| asp quindi fai la classica retta di taratura mica è a più variabili però..secondo me conviene calcolare la deviazione standard della retta Sr e vedere se puoi riutilizzarla (oppure vedere i limiti di confidenza della pendenza) |
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ello82
Nuovo Arrivato
Prov.: Milano
Città: Neviano
34 Messaggi |
Inserito il - 29 giugno 2010 : 12:23:18
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si è una classica retta di taratura (o regressione a dir si voglia) in cui la variabile dipendente (Y) resta costante e l'indipendete (X) varia in base allo strumento. il punto è che io avrò una tabella con una Y e Xgiugno, Xluglio, Xagosto ecc. il mio R2 di ognuna è molto alto (circa 0.98) e tra una e la'ltra varia di pochissimo (R2giugno 0.999; R2Luglio 0.985 R2agosto 0.979 ecc). quindi io volgio mediare questi valori per ottenere un unica retta che riutilizzo per i campioni singoli che ottengo.
io considero a più variabili perchè ho diverse X ma forse sbaglio...cmq diciamo che sono ripetizioni dello stesso plasmide, ma ciò che fa amplificare il segnale (la famosa mix di reazione) viene fatta nuova ogni volta, per cui voglio testare che la mix sia efficiente e libera da inquinanti prima di testare i pazienti.
Lo scopo del mio post è solo quello di capire come mediare le mie diverse rette per ottenere una che ha un intervallo di punti e non un punto singolo in cui a una Y corrispondano in verità più X. perciò ottenute le diverse rette vorrei capire se posso mediare i valori della X oppure dei coefficienti angolari per ottenere una nuova retta di regressione (o taratura) |
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TMax
Utente Junior
Prov.: BG
Città: Capriate
270 Messaggi |
Inserito il - 29 giugno 2010 : 14:45:05
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forse la cosa più corretta sarebbe adattare un modello ad effetti misti usando sia il singolo soggetto, sia la ripetizione come fattori ad effetto random e come effetto fisso solo la variabile X. Alla fine hai una regressione in cui hai controllato opportunamente la variabilità dovuta al singolo soggetto e al momento del prelievo.
mediare i coefficienti angolari non è molto corretto perchè i coefficienti angolari sono delle statistiche con un grado d'incertezza che non puoi non considerare quando cerchi di sintetizzare i risultati
modelli del genere si usano anche in corso di metanalisi ( dette metaregressioni) e servono per mediare i risultati di studi differenti.. inq eui casi il fattore studio è considerato un fattore ad effetto random!
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ello82
Nuovo Arrivato
Prov.: Milano
Città: Neviano
34 Messaggi |
Inserito il - 01 luglio 2010 : 13:25:09
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| la X e le ripetizioni sono la stessa cosa, inoltre i campioni sono esterni alla retta di taratura. per crearla io uso plasmidi non altri campioni. io vorrei solo sapere se posso mediare i valori dei plasmidi per ottenere una retta di regressione mediata tutto qui... |
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chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 01 luglio 2010 : 13:38:31
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| dire che i campioni sono esterni alla taratura intendi dire che sono fuori dal LOQ?? |
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ello82
Nuovo Arrivato
Prov.: Milano
Città: Neviano
34 Messaggi |
Inserito il - 01 luglio 2010 : 15:53:25
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non ho idea di cosa sia la LOQ cmq intendo che i campioni non li uso per costruire la retta. per quella ho dei plasmidi esclusivi. una volta costruita la sfrutto per ottenere la concentrazione dai campioni incongiti, ricavo cioè il valore incognito (cosa che nei plasmidi è conosciuto per ovvi motivi). io voglio riutilizzare la retta, medaita con le precedenti rette (sempre con i plasmidi), per scoprire la concentrazione di futuri campioni. |
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Retta di regressione a più variabili
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