Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 Laboratorio
 Bioinformatica e Biostatistica
 Bionformatica STS
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

morgana83
Nuovo Arrivato



44 Messaggi

Inserito il - 09 luglio 2010 : 17:42:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di morgana83 Invia a morgana83 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti! ho un problema con questo esercizio di bioinformatica, che prevede la conoscenza di map viewer:
trovare le posizioni del gene umanoF9 e riportare la localizzazione sulla mappa genomica di due STS del gene.

Le posizioni del gene sono:
START: 138612895
STOP: 138645617

Riporto alcune STS:

138612094 138612319
138612187 138612711
138612194 138612549
138612850 138613275
138618203 138618500
138618204 138618566
138618227 138618556
138619208 138619545

io ho scritto che dalla quarta in giù sono tutte comprese nel gene, ma non capisco come si fa a sceglierle...è una domanda stupida, ma se qualcuno di buona volotà riuscisse ad illuminarmi mi farebbe un grosso favore!!

grazie mille in anticipo

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 12 luglio 2010 : 10:01:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Credo che il prof ti stia semplicemente chiedendo di sceglierne due a caso, visto che la lista di STS è molto lunga e non è necessario riportare la lista completa.

Stai attenta perchè nella lista di STS che hai postato, mi sembra che una o due si trovano fuori dal gene... ti conviene scegliere due STS che siano totalmente incluse nelle coordinate di inizio e fine del gene.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
Torna all'inizio della Pagina

morgana83
Nuovo Arrivato



44 Messaggi

Inserito il - 12 luglio 2010 : 11:02:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di morgana83 Invia a morgana83 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie per la risposta! per non sbagliare a scegliere (la prof chiede di scriverne due comprese nel gene), posso riportare quelle che vedo su map viewer, lasciando lo zoom al minimo in modo da avere un campo più ristretto e visualizzare meno marcatori? cioè: quelle che visualizzo se non aumento lo zoom saranno sicuramente incluse nelle coordinate del gene...?
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina