| Autore |
Discussione |
|
|
Ale_90
Utente Junior
296 Messaggi |
 Inserito il - 15 luglio 2010 : 13:20:25
|
Spero di non aver sbagliato categoria....Qualcuno riesce ad illuminarmi sul funzionamento della duplicazione sul frammento ritardato? Sto diventando matto, perchè faccio fatica a concepire questo meccanismo di "cucitura all'indietro" com'è presentato dall'Alberts...Senza contare che le animazioni sono le più diverse, e paradossalmente, mi sembrano tutte buone...
Grazie in anticipo!
|
|
|
|
|
Caivs.Ivlivs
Utente Junior
Città: Brescia
302 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2010 : 13:45:56
|
E' molto semplice.
Se la DNA polimerasi riesce a sintetizzare solo in senso 5'-3', non può sintetizzare in maniera continua, partendo da un singolo primer, il filamento antiparallelo.
Filamento "guida": sintesi a partire dal punto di denaturazione in poi: la sintesi è continua, poiché la denaturazione ha lo stesso verso di sintesi.
Filamento antiparallelo: se la DNA polimerasi sintetizza sempre in senso 5'-3', abbiamo che la denaturazione è per forza di cose opposta al senso di sintesi. Ergo, la DNA polimerasi si fermerà ogni tot e, man mano che avviene la denaturazione in senso opposto, la Primasi sintetizza un primer dal quale la DNA polimerasi sintetizzerà un filamento di Okazaki fino a giungere al primer posizionato precedentemente.
Non so se ti è chiaro... è tutta questione di logica, comunque: è molto semplice da comprendere. |
 |
|
|
Ale_90
Utente Junior
296 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2010 : 14:06:21
|
| Però deve formarsi una specie di ansa, altrimenti la polimerasi non può allungare il primer, o sbaglio? |
|
|
|
Caivs.Ivlivs
Utente Junior
Città: Brescia
302 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2010 : 14:43:14
|
| Durante la replicazione viene a formarsi un "rocchetto" sul quale il DNA ha modo di ripiegarsi su se stesso riformandosi tipo a "spirale", se non ricordo male. |
|
|
|
SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2010 : 15:32:46
|
| Il modello attuale prevede la formazione di un'ansa, in modo che il filamento lagging sia parzialmente orientato verso la direzione di scorrimento del complesso polimerasico e sia replicato parzialmente in fase con il filamento leading. C'è un topic simile nella sezione biochimica, ti consiglio di leggerlo. Il rocchetto di cui parli tu Caius sembrerebbe + il complesso istonico. Durante replicazione e trascrizione si assiste anche a un rimodellamento dei complessi istonici (si disassemblano per lasciar passare le polimerasi e si riassemblano dopo il loro passaggio, non sempre poi nella stessa posizione). |
 |
|
|
|
Caivs.Ivlivs
Utente Junior
Città: Brescia
302 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2010 : 15:48:08
|
| Io ricordavo che la polimerasi si rimodellava con le sue subunità in modo da far sì che i due filamenti di DNA potessero scorrere l'uno indipdentemente dall'altro in direzione opposta. |
|
|
|
Ale_90
Utente Junior
296 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2010 : 16:50:34
|
| Grazie mille!L'animazione che ho trovato nel topic mi ha aiutato tantissimo, grazie! :) |
|
|
|
SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2010 : 17:15:20
|
Citazione:
Messaggio inserito da Caivs.Ivlivs
Io ricordavo che la polimerasi si rimodellava con le sue subunità in modo da far sì che i due filamenti di DNA potessero scorrere l'uno indipdentemente dall'altro in direzione opposta.
Certo, anche il complesso polimerasico va incontro a cambiamenti associandosi o dissociandosi dalle varie subunità, come per esempio la primasi nel filamento lagging. Direi che non esiste nulla di statico all'interno (e all'esterno) della cellula, ogni cosa ha la sua dinamica e il suo meccanismo di azione e la funzione di una determinata proteina spesso, se non sempre, è determinata dai "partner" che si associano a detta proteina. |
|
|
|
|
syd
Nuovo Arrivato
27 Messaggi |
Inserito il - 16 luglio 2010 : 17:54:00
|
Il filamento tardivo deve essere sintetizzato in direzione opposta a quello veloce(sempre dall'estremità 5'--> 3'), sotto forma di piccoli frammenti discontinui(frammenti di Okazaki). Per questo motivo il filamento tardivo è composto da diversi filamenti, la cui sintesi inizia vicino alla forca replicativa in questo modo:
1) si parte da un innesco (primer) da parte dell'enzima DNA polimerasi III.
2) il primer verrà poi rimosso dall'enzima RNAsi H e sostituito con DNA da parte della DNA polimerasi I.
3) il frammento viene poi legato al frammento successivo da parte della DNA ligasi tramite un legame fosfodiesterico per creare una catena di DNA continua.
spero di esserti stato d'aiuto! |
|
|
|
Ale_90
Utente Junior
296 Messaggi |
Inserito il - 16 luglio 2010 : 17:57:09
|
| Sicuramente! Il mio dubbio era legato alla formazione del loop, ma sicuramente una rinfrescata al resto del meccanismo non può farmi che bene! ;) |
|
|
| |
Discussione |
|
Frammenti di Okazaki
Didattica
