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cris90
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3 Messaggi

Inserito il - 21 settembre 2010 : 13:09:49

Ciao a tutti!
Sto preparando l'esame di genetica (faccio medicina) e una cosa non mi � chiara: l'analisi delle CNVs. Purtroppo sul libro non ho trovato nulla e non ho capito bene la spiegazione data a lezione... qualcuno pu� aiutarmi?
Grazie mille in anticipo

tittideby
Nuovo Arrivato

65 Messaggi

Inserito il - 23 settembre 2010 : 17:03:18

Allora CNVs vuol dire variazione del numero di copie di un allele.Un es.classico � riferito all'enzima amilasi.Se considerassimo una popolazione che vive di caccia con una che vive di agricoltura vedremmo che nella prima il numero di copie relative al gene sarebbe per es 4 ...mentre nell'altra si avrebbero ben 10 copie.Ora qst perch�? perch� la fitness cio� l'adattabilit� di quel genotipo � maggiore in quelle condizioni ....che detto in gergo vuol dire che...grazie alle dieci copie la popolazione che vive di agricoltura digerisce meglio,quindi le 10 copie gli fanno comodo e gli servono(perdonate la troppa semplicit�).Come fai a verificare che una ne ha 10 copie e l'altra ne ha 4? Fai un'analisi di CGH associata all'ARRAY.
Ovvero estrai DNA umano dalla placenta e prepari il cos� detto CAT-1 cio� lo frammenti,lo denaturi e poi lo metti in condizioni rinaturanti per 1h a 37 gradi centigradi.Avrai che le sequenze ripetute si appaieranno tra loro.
Ora....estrai i due genomi dei soggetti che vuoi analizzare li marchi con fluorofori diversi(di solito cianine) e li metti in presenza del DNA CAT-1 .Cos� farai in modo che le seq ripetute dei genomi degli individui che stai analizzando vengano "mascherate" dall'ibridazione con il DNA CAT-1.
Adesso si presuppone tu abbia gi� una library di bac e ogni bac contenente il suo bel frammento sia disposto in un pozzetto dell'array.Vai ad ibridare il dna degli individui sull'array e otterrai chiaramente fluorescenza se c'� ibridazione.
Per capire se il num di copie � diverso tra un soggetto ed un altro dovrei comparare l'intensit� del segnale fluorescente.
Se hai la stessa intensit� allora hai lo stesso numero di copie
Se hai in uno intensit� inferiore l� hai una delezione quindi un numero di copie inferiore
Se hai in uno intensit� maggiore l� hai duplicazione quindi un numero maggiore di copie.
Spero di essere stata chiara e di averti aiutata.
Ciaooooooooooooo

cris90
Nuovo Arrivato

3 Messaggi

Inserito il - 24 settembre 2010 : 11:49:56

Grazie mille