Ciao a tutti, per quanto riguarda l'analisi dei genomi chi saprebbe spiegarmi come avviene la marcatura dei frammenti terminali all'estremità 3'?Cosa sono le estremità 3' recessed e come si ottengono? aiuto...l'esame è sempre più vicino!
Allora, la marcatura in 3' si fa in genere usando la terminal-trasferasi che è un enzima che attacca nucleotidi in 3' ad una qualsiasi catena di DNA. Se fai incubare il DNA da marcare con l'enzima + ad es. timidina triziata hai marcato in 3' il DNA.
Le estremità recessed, dette anche "sticky ends" (cioè estremità appiccicose) possono essere sia 3' che 5' e derivano dal taglio del DNA con un enzima di restrizione. Gli enzimi di restrizione tagliano il DNA a livello di una certa sequenza tipica dell'enzima e possono tagliare allo stesso punto su entrambe le catene, generando un'estremità blunt, cioè piatta, o in punti sfalsati sulle due catene, generando un'estremità sticky, con una catena + lunga dell'altra.