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Discussione

marco_86
Nuovo Arrivato

Prov.: parma
Citt�: salsomaggiore

18 Messaggi

Inserito il - 01 novembre 2010 : 11:13:09

scusate volevo chiedere una cosa...
nelle metallo proteasi lo ione metallico, spesso Zn 2+, � coordinato da 3 AA (his, his, glu) e la 4� posizione di coordinazione occupata dall'acqua; poi c'� un glu in genere che attiva l'acqua prendendogli un protone e lei pu� essere OH- grazie al metallo che stabilizza...ok?
per� mi chiedo se il metallo fa anche l'attivazione del substrato...

domanda: il metallo fa tutte e due? attiva il substrato (rende elettrofilo il carbonile) e il nucleofilo (acqua) p solo uno delle due?

es nella carbossipeptidasi ok entrambe, ma nella termolisina non � entrambe...

nashita
Utente

Prov.: Puglia

1085 Messaggi

Inserito il - 04 novembre 2010 : 14:06:49

da quel che mi risulta ..se ti riferisci solo al metallo, lo zinco fa attivazione sull'acqua e quest'ultima agisce poi come nucleofilo sul carbonio carbonilico del peptide.
Il sito attivo dell'enzima metallo proteasi (che appunto comprende anche lo Zinco), possiede le caratteristiche che permettono la polarizzazione del legame carbonilico e la stabilizzazione dell'intermedio tetraedrico formatosi.