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Donde
Utente Junior
272 Messaggi |
 Inserito il - 11 novembre 2010 : 15:33:58
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ciao a tutti. vorrei chiedervi una cosa che non mi è molto chiara.
sul libro ho letto le seguenti cose:
1) il rimodellamento della cromatina in corrispondenza di un gene (in particolare sul promotore) è fondamentale affinché possa avvenire la trascrizione. questo in quanto il DNA è inizialmente compattato sui nucleosomi (stato inattivo).
in seguito al rimodellamento della cromatina si passa ad uno stato attivo in cui i nucleosomi si sono spostati o hanno cambiato struttura e il DNA risulta più accessibile all'apparato trascrizionale e quindi la trascrizione può avvenire.
2) la cromatina può trovarsi in stato di eucromatina ed eterocromatina. la prima è trascrizionalmente attiva, la seconda è inattiva. quando lo stato di eterocromatina è limitato ad una regione piccola, con lo scopo di spegnere un gene, si parla di silenziamento.
quello che non capisco è se parlare di eucromatina e stato attivo è la stessa cosa, oppure se sono due eventi diversi che devono accadere entrambi affinché avvenga la trascrizione.
in altre parole, se la cromatina è in stato di eucromatina, vuol dire che è in corso la trascrizione? oppure affiché la trascrizione possa avvenire è necessario che la cromatina sia ulteriormente rimodellata per renderla nello stato attivo in cui nei nucleosomi il DNA è più accessibile alla trascrizione?
vi ringrazio infinitamente per l'aiuto
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"DNA just is. And we dance to its music." |
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Daria85
Utente
678 Messaggi |
Inserito il - 11 novembre 2010 : 19:14:44
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l eucromatina è una cromatina più lassa, quindi accessibile all'apparato trascrizionale.
quindi non è detto che l eucromatina sia tradotta, ma semplicemente che può esserlo, per esempio a seguito dell'attivazioni di specifici TF.
il rimodellamento della cromatina è alla base dell'eucromatina, poichè questa per essere più lassa avrà subito modificazioni istoniche (acetilazione) e anche a livello del DNA ( demetilazione promotore)
ciao |
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Donde
Utente Junior
272 Messaggi |
Inserito il - 11 novembre 2010 : 22:58:58
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| quindi per essere trascritta l'eucromatina deve essere ulteriormente rimodellata? cioè grazie a complessi rimodellatori come swi/snf il DNA del promotore deve essere reso più accessibile, giusto? |
"DNA just is. And we dance to its music." |
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_pietro_
Nuovo Arrivato
Città: Lund
104 Messaggi |
Inserito il - 12 novembre 2010 : 10:37:39
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La cromatina per essere trascritta deve essere, come diceva Daria (brava la Estense), in uno stato rilassato. Esistono diversi marker epigenetici di eucromatina, i piu' importanti e meno controversi sembrano essere l'acetilazione degli istoni e la non metilazione (piu' che la demetilazione) dei promotori, visto che la metilazione delle citosine. Altri marker possono esistere, come la metilazione degli istoni, ma questo e' un argomento un po' contorto.
Tutto cio' e' sufficiente per attivare la trascrizione? Certo che no, ma dire che swi/snf sia richiesto, direi che ne passa. Ma puo' esserne senz'altro un fattore. Quello che e' necessario e' il richiamo della RNAp e di tutto l'armamentario di TF al seguito, altrimenti ciccia...
E, tanto per smentire me stesso, giusto ieri mi sono letto l'abstract di questo articolo:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21060865 |
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Daria85
Utente
678 Messaggi |
Inserito il - 12 novembre 2010 : 11:36:47
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[quote]Messaggio inserito da _pietro_
La cromatina per essere trascritta deve essere, come diceva Daria (brava la Estense), in uno stato rilassato. Esistono diversi marker epigenetici di eucromatina, i piu' importanti e meno controversi sembrano essere l'acetilazione degli istoni e la non metilazione (piu' che la demetilazione) dei promotori, visto che la metilazione delle citosine.
grazie Pietro;)
hai ragione, ho scritto demetilazione intendendo non metilazione...erroraccio mio! ;)
ziao |
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_pietro_
Nuovo Arrivato
Città: Lund
104 Messaggi |
Inserito il - 12 novembre 2010 : 11:41:17
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Citazione:
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hai ragione, ho scritto demetilazione intendendo non metilazione...erroraccio mio! ;)
No, non e' un erroraccio, anche perche' recentemente si sono scoperti i primi probabili meccanismi di demetilazione del DNA in mammiferi. Il discorso era che sembrava che un promotore sia metilato di default e venga demetilato in caso di trascrizione del gene...
Sai, siamo nel mio campo
PIGNOLO E ******** (cit.)
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Daria85
Utente
678 Messaggi |
Inserito il - 12 novembre 2010 : 11:45:14
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...troppo buono ;)
hihihi |
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chiarimenti riguardo la cromatina
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