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sere85
Nuovo Arrivato


Prov.: Bologna
Città: monterenzio


29 Messaggi

Inserito il - 16 dicembre 2010 : 13:01:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di sere85 Invia a sere85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti,
sto leggendo un'articolo sulla biodiversità microbica delle stromatoliti viventi di Shark Bay, ma non capisco la sequenzialità delle tecniche utilizzate.
1) estrazione del DNA genomico totale
2) amplificazione del rDNA 16S attraverso primers specifici
3)costruzione di una libreria di cloni(batteri, cianobatteri e archea)da estrazione da gel.
4)un centinaio di cloni per ciascuna libreria è stato selezionato e sottoposto a screening tramite RFLP.
Non capisco perchè non potevano confrontare direttamente le sequenze di rDNA 16S con quelle presenti in database e costruire l'albero filogenetico, ma abbiano dovuto clonare e poi sottoporre i cloni a sreening.
L'articolo originale è:" Microbial diversity of extant stromatolites in the hypersaline marine environment of Shark Bay , Australia.

Grazie mille pre la disponibilità

Soltanto chi non ha approfondito nulla può avere delle convinzioni.
Emil Cioran

Jo84
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 04 novembre 2012 : 09:53:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Jo84 Invia a Jo84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao!
Volevo chiederti se per caso poi le sequenze 16S rDNA amplificate le avete sequenziate per identificare i singoli individui batterici.
Se si, che tecniche avete usato?
Grazie
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