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steffi85
Nuovo Arrivato


Prov.: Mantova
Città: castiglione delle stiviere


25 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2011 : 16:11:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di steffi85 Invia a steffi85 un Messaggio Privato
Ragazzi AIUTO!!!

Ho effettuato un allineamento tra due proteine (pessimo, perchè sono molto dissimili!). Una domanda, intanto, ma i valori RMS dei residui, che si alzano parecchio prima di un gap, sono dovuti alla possibile presenza di loop, o non c'entra nulla?
Poi un'altra cosa... dopo aver fatto l'allineamento, mi viene chiesto di colorare una delle due proteine per rmsd, e questo il programma non me lo fa fare!!! ma perchè?
C'è nessuno che sappia dirmi come agire e come riconoscere la regione più dissimile dalla seconda proteina?

Grazie a tutti!

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1724 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2011 : 21:26:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato
Ti prego di non aprire lo stesso topic in più sezioni del forum (come da regolameto http://www.molecularlab.it/forum/regolamento.asp )
Si continua qui:
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=21256

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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