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 Bioinformatica e Biostatistica
 differenza tra banche dati primarie e specializzate
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alessandravb
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Prov.: mi


23 Messaggi

Inserito il - 03 febbraio 2011 : 20:25:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di alessandravb Invia a alessandravb un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sul testo trovo scritto che le banche dati di proteine possono essere considerate sia banche dati primarie che specializzare...perchč?

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 04 febbraio 2011 : 14:19:17  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
E' una definizione un po' artificiale e a me personalmente non piace la maniera in cui č spiegata nei corsi di bioinformatica.

Un database primario č un database che contiene dati originali, dove questi vengono depositati per la prima volta.
Per esempio, GenBank č un database primario di sequenze, che contiene tutte le sequenze nucleotidiche conosciute. Quando un gruppo di ricerca scopre la sequenza di un nuovo gene e lo sequenzia, invia il risultato a GenBank dove questa sequenza viene pubblicata.

Un database secondario o specializzato prende le informazioni da un database primario e le annota in maniera che siano piu' utili ai ricercatori che lavorano in una determinata area. Per esempio, un database secondario potrebbe annotare solo le proteine di membrana, annotando informazioni utili ai ricercatori interessati alle proteine di membrana, come le sequenze segnale etc..

Piu' che una definizione da imparare a memoria, si tratta di un esempio per farti capire che tipo di dati ti puoi aspettare da un database, e per spiegare la differenza tra Genbank, Uniprot, etc.. e gli altri db.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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