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 LOHs vs CNVs in aCGH (affymetrix)
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dottorbarbozzi
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Città: Perugia


6 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2011 : 18:30:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dottorbarbozzi Invia a dottorbarbozzi un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve vorrei porre un quesito al quale non trovo una risposta esauriente in letteratura e al quale ho provato a rispondermi da solo ma vorrei girarvelo...
Utilizzo la piattaforma di SNPaCGH Affymetrix 2.7M di "citogenetica" (la chiamano così)ed ho un dubbio sulla capacità della piattaforma, ma direi più della metodica stessa, relativo al minimo clone detectabile in termini di percentuale.
Venendo dall'utilizzo di altre piattaforme che non studiano le LOHs (o LCSHs) ho un mio riferimento relativo agli sbilanciamenti ma non ho esperienza per quanto riguarda la perdita di eterozigosi: cioè quale è la percentuale minima di cellule (clone maligno o mosaico)che deve presentare una perdita di eterozigosi perchè tale variazione sia "vista" dal sistema?
Grazie in anticipo
Gianluca
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