| Autore |
Discussione |
|
|
M111
Utente
Prov.: Lucca
Città: Guamo
838 Messaggi |
 Inserito il - 15 febbraio 2011 : 16:27:03
|
A volte mi è capitato di scriver qua sopra i miei sogni per il futuro, la b. strutturale.
Aspettando il secondo semestre per iniziare il corso di Cristallografia decisi di seguire un corso di Molecular Modelling, sono rimasto veramente molto colpito ed ho già sostenuto (già da un po') con felice esito l'esame. Forse non seguirò nemmeno crist. per approfondire con un nuovo corso calendarizzato proprio alcuni giorni fa, ancora di modellistica.
Al di la di queste premesse, mi domando se vi è qualcuno che sta facendo od ha fatto studi di Dinamica Molecolare in riferimento a tematiche biologiche, mi riferisco preferenzialmente a quelli col Bio davanti :)
Immagino che qualche bioinformatico ci sia....o almeno lo spero :)
Grazie a tutti.
|
|
|
|
|
chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 15 febbraio 2011 : 17:18:30
|
si certo fatta come metodi razionale di progettazione di farmaci fatta anche con matematica dietro per mia fortuna-sfortuna  |
 |
|
|
M111
Utente
Prov.: Lucca
Città: Guamo
838 Messaggi |
Inserito il - 15 febbraio 2011 : 17:32:04
|
...per curiosità spicciola, spicciola, a che ordine temporale e con quali step?
Che metodi di integrazione utilizzate?
ma comunque....in generale, per i vostri studi usate metodi QMMM?
|
|
|
|
chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 15 febbraio 2011 : 17:48:25
|
se non erro espansione in serie di Taylor (ma dovrei rivedere )...
metodi QMMM ti riferisci a QM/MM? cioè ai metodi misti?
Dipende dal calcolatore, su un normale pc ha poco senso al momento tipo quelli ab initio http://www.s-in.it/it/prodotto.php/581 |
|
|
|
M111
Utente
Prov.: Lucca
Città: Guamo
838 Messaggi |
Inserito il - 16 febbraio 2011 : 09:25:17
|
Si l'approssimazione come espansione in serie di Taylor è comune a praticamente tutti i metodi, avrete forse usato Verlet? o magari Leap Frog....vabbè dai....poi io ne so ancora poco purtroppo.
Vabbè dai, non importa, non voglio farti perder tempo a riprendere cose passate per soddisfare una mia mera curiosità spicciola e fine a se stessa....
Effettivamente gli ab initio saranno sicuramente più adatti ai vostri scopi, per questo mi sono riferito a quelli con la Bio davanti, che sicuramente al massimo utilizzeranno i QM/MM visto che solo di QM non si può lavorare :)
Mi i piacerebbe scambiare quattro chiacchere con chi se ne occupa da Biologo :D |
|
|
|
chim2
Utente Attivo
2110 Messaggi |
Inserito il - 16 febbraio 2011 : 11:38:05
|
si anche verlet.....ma anche le teorie di fisica statistica quali monte carlo.
Tieni d'occhio questo sito http://www.chimica.unipd.it/gicc/pubblica/scuole.htm ,anche se non è molto aggiornato magari trovi qualche scuola a cui puoi potrai partecipare un giorno  |
|
|
|
M111
Utente
Prov.: Lucca
Città: Guamo
838 Messaggi |
Inserito il - 16 febbraio 2011 : 11:57:01
|
Chissà dove finirò eheh....o...come finirò ahahah :D
Per l'MC si mi interessa molto perchè è un approccio molto condiviso, però per la tematica biologica è sicuramente più....funzionale...il metodo deterministico.
Ad ogni modo è molto facile trovar chimici con cui parlare ma molto difficile biologi, spero di riuscire a trovarne con questo intervento. |
|
|
|
M111
Utente
Prov.: Lucca
Città: Guamo
838 Messaggi |
Inserito il - 18 febbraio 2011 : 15:45:56
|
| Bhè...mi va bene anche chi si occupa di simulazioni in genere :D :D |
|
|
| |
Discussione |
|
Dinamica molecolare
Guide tools online
