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 come vien prodotta proteina influenza funzione?
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fpotpot
Utente

Città: middleofnowhere


1056 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2006 : 12:21:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fpotpot Invia a fpotpot un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti!
ipotizzate di avere una proteina della saliva,con cui lavorate.
la domanda e':puo'esserci una differenza funzionale tra una proteina sintetizzata chimicamente come sequenza di aa,la proteina quando e' purificata con cromatografia dalla saliva e la proteina quando viene prodotta da un e.coli o un lievito dove e' stato clonato il gene che la codifica?

Gabriele
Utente

Prov.: Pisa
Città: Pisa


615 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2006 : 13:32:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gabriele Invia a Gabriele un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La proteina sintetizzata potrebbe mancare di modificazioni post-trasduzionali essenziali per il suo corretto funzionamento.
Acetilazioni,metilazioni,glicosilazioni etc.

"Chi rinuncia alla libertà per la sicurezza, non merita né la libertà né la sicurezza. E finirà col perdere entrambe."
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fpotpot
Utente

Città: middleofnowhere


1056 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2006 : 13:46:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fpotpot Invia a fpotpot un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
mmm...e come faccio a vedere questo?la sequenza e' la stessa...
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AleXo
Moderatore

OrniAle

Prov.: Estero
Città: San Francisco, California


1550 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2006 : 15:15:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AleXo  Invia a AleXo un messaggio AOL Invia a AleXo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
nice question!
sono di fretta ma ad esempio la glicosilazione altererà parekkio il peso molecolare apparente in sds-page. Così come un eventuale processo di maturazione proteolitico...

ma nulla è noto su questa proteina?

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fpotpot
Utente

Città: middleofnowhere


1056 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2006 : 15:29:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fpotpot Invia a fpotpot un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
e' nota la sequenza completa,son solo 43 aa,si sa che la parte N terminale (1-21 aa)ha due serine fosforilate in 2nda e 3a posizione e sembra avere confromazione di alfaelica.La funzione di questa parte sembra essere di essere assorbita al minerale dello smalto dei denti Ma la parte C-terminale (in teoria random coil)nn si assorbe al minerale e sembrerebbe avere degli epitopi riconosciuti da qualche specie di batteri.
Non ci sono cisteine e quinsi non S-S ponti che facciano pensare a condizioni redox che influenzino attivita'.
detto questo...
help!!
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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2006 : 16:35:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da fpotpot

ciao a tutti!
ipotizzate di avere una proteina della saliva,con cui lavorate.
la domanda e':puo'esserci una differenza funzionale tra una proteina sintetizzata chimicamente come sequenza di aa,la proteina quando e' purificata con cromatografia dalla saliva e la proteina quando viene prodotta da un e.coli o un lievito dove e' stato clonato il gene che la codifica?

Mi vengono in mente le forme di splicing.
Ricorda che esiste anche lo splicing a livello della sequenza aminoacidica (dopo quello dell'RNA), e che anche i prodotti che apparentemente non hanno significato possono essere importanti.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 20 ottobre 2006 : 05:35:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Coli fa solo acetilazione, non glicosilazione.
Il lievito può anche glicosilare ma magari non nello stesso modo delle cellule eucariotiche superiori.

Puoi notare le differenze su SDS-page o cromatografia, inoltre se cerchi delle sequenze di glicosilazione sulla proteina puoi poi trattare con glicosilasi specifiche e vedere se la proteina corre diversamente su sds-page prima e dopo il trattamento.

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fpotpot
Utente

Città: middleofnowhere


1056 Messaggi

Inserito il - 20 ottobre 2006 : 11:11:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fpotpot Invia a fpotpot un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
mmmmm....mumble mumble....grazie mille!!!
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