Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 Laboratorio
 Genetica
 Esercizio su Neurospora Crassa
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

kiarabiz
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 09 maggio 2011 : 14:34:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kiarabiz Invia a kiarabiz un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao,la mia prof di genetica m ha dato questo esercizio:
i geni a,b e c sono sullo stesso braccio cromosomico in neurospora. i seguenti aschi ordinati sono stati ottenuti dall'incrocio a b + x + + c

 45    5    146    1     10    20    15    58
ab+   ab+   ab+   ab+   ab+   ab+   ab+   ab+
+bc   a++   ab+   +++   a+c   ++c   abc   +b+
a++   +bc   ++c   abc   +b+   ab+   +++   a+c
++c   ++c   ++c   ++c   ++c   ++c   ++c   ++c


determinare il corretto ordine dei geni
e determinare tutte le distanze gene-gene e gene centromero.

qlcn m può spiegare come devo fare l'esercizio???m sono bloccata e nn riesco ad andare avanti!!!grazie

GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 10 maggio 2011 : 00:33:11  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao e benvenuta su MolecularLab!

Per favore leggi il regolamento e non postare la stessa cosa più volte, né come nuova discussione né come risposta ad altre discussioni altrimenti si genera solo confusione, una volta è più che sufficiente! Ho eliminato i doppioni del tuo messaggio.

In questa discussione: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=22220
a cui avevi risposto era spiegato l'esercizio, ma visto che non ti era chiaro rispiego qua passo per passo come si fa, magari sarà utile anche ad altri.


Abbiamo questi aschi ordinati:

 45    5    146    1     10    20    15    58
ab+   ab+   ab+   ab+   ab+   ab+   ab+   ab+
+bc   a++   ab+   +++   a+c   ++c   abc   +b+
a++   +bc   ++c   abc   +b+   ab+   +++   a+c
++c   ++c   ++c   ++c   ++c   ++c   ++c   ++c


Calcolo distanza tra 2 geni:

Per calcolare la distanza tra 2 geni si utilizza la seguente formula
(1/2T + DNP)/TOT

Innanzitutto devi considerare 2 geni alla volta e individuare quali siano i ditipi parentali (DP), i tetratipi (T) e i ditipi non parentali (DNP).
Iniziamo con la coppia a-b, considerando solo a e b gli aschi sono questi:

 45    5    146    1    10    20    15    58
 ab   ab    ab    ab    ab    ab    ab    ab
 +b   a+    ab    ++    a+    ++    ab    +b
 a+   +b    ++    ab    +b    ab    ++    a+
 ++   ++    ++    ++    ++    ++    ++    ++
 T    T    DP   DP    T    DP   DP    T

ci sono solo DP e T e non DNP, prendi quindi i T e applichi la formula: (1/2T + DNP)/TOT (che diventa (1/2T)/TOT
a-b = 1/2 (45 + 5 + 10 + 58)/300 = 0.196 = 19.6cM
hai trovato la distanza tra a e b.
Ora fai la stessa cosa per le altre coppie di geni.

(scrivo solo il numero di aschi e il tipo)

b-c
45    5    146    1    10    20    15    58
 T    T     DP    T    DP    DP    T     DP

b-c = 1/2 (45 + 5 + 1 + 15)/300 = 0.11 = 11cM

a-c
45    5    146    1    10    20    15    58
DP    DP    DP    T     T    DP    T     T

a-c = 1/2 (1 + 10 + 15+58)/300 = 0.14 = 14cM

Calcolo distanza gene-centromero:

Bisogna considerare un gene alla volta e vedere se segrega in prima o in seconda divisione meiotica, poi per il calcolo della distanza si utilizza la seguente formula:
1/2 (segreganti 2°)/totale

Consideriamo il gene "a":
- i segreganti in prima divisione meiotica saranno 2:2 (AAaa o aaAA)
- i segreganti in seconda divisione meiotica saranno 1:1:1:1 (AaAa) e 1:2:1 (AaaA o aAAa)
quindi:

 45    5    146    1    10    20    15    58
  a    a     a     a     a     a     a     a
  +    a     a     +     a     +     a     +
  a    +     +     a     +     a     +     a
  +    +     +     +     +     +     +     +
 2°   1°   1°    2°   1°   2°    1°   2°

Per gli altri geni invece ho:

b
45    5    146    1    10    20    15    58
 1°  2°    1°   2°   2°   2°   1°   1°

c
45    5    146    1    10    20    15    58
2°   1°   1°    1°   2°   2°   2°   1°

Applicando la formula: 1/2(segr. 2°)/tot
a-centromero = 1/2 ( 45 + 1 + 20 + 58)/300 = 0.207 = 20.7cM
b-centromero = 1/2 ( 5 + 1 + 10 + 20)/300 = 0.06 = 6cM
c-centromero = 1/2 (45 + 10 + 20 + 15)/300 = 0.15 = 15cM

L'ordine dei geni sapendo tutte le distanze è banale:
O----b----c-----a

Torna all'inizio della Pagina

kiarabiz
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 10 maggio 2011 : 23:29:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kiarabiz Invia a kiarabiz un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie ,sei stata gentilissima a rispiegarmelo!!!! sbagliavo perchè consideravo tt e tre i geni contemporaneamente e quindi nn m trovavo qnd andavo a vedere chi segregava in prima e seconda divisione!!!

Ps:ho letto il regolamento scusa!!!
Torna all'inizio della Pagina

masna
Nuovo Arrivato

chromosome



74 Messaggi

Inserito il - 08 settembre 2012 : 15:59:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di masna Invia a masna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao GFPina, ho trovato questo esercizio sul russell, ed ho provato ad eseguirlo, trovando alcune incongruenze.
ora mi accorgo di aver fatto i calcoli esattamente come l'hai risolto tu.

la cosa che non mi torna, è che non riesco a trovare una disposizione che si adatti con i calcoli delle distanze tra i geni, e quelle tra il centromero.
però anche sul russell nella risoluzione conferma questa disposizione...
c'è qualcosa che non ho capito riguardo questi esercizi?


disponendoli come hai fatto tu, risulterebbe:

15-6 = 9um per la coppia bc
20.6-6 = 14,6um, per la coppia ab
20-15 = 5um, per la coppia ac
Torna all'inizio della Pagina

GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 08 settembre 2012 : 16:52:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Come ti ho risposto nell'altra discussione trovi la risposta a questo dubbio qui: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?whichpage=1&TOPIC_ID=25558#118698
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina