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 Ricerca di Omologia e costruzione albero filogenetico.
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laviadellavirtu
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51 Messaggi

Inserito il - 11 giugno 2011 : 12:11:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di laviadellavirtu Invia a laviadellavirtu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve,

avrei bisogno del vostro aiuto.
Mi trovo davanti una sequenza proteica Di Coli. accession number ZP_03028091
VOglio capire a cosa è omologa per capire se posso ipotizzare una sua funzione...

dopo la ricerca in BlastP trovo solo proteine di Coli...di ceppi diversi...(in allegato)
Tutti questi ceppi cosa sono?
se voglio capire la funzione di questa proteina voi che fareste???
ho capito che è una proteina di membrana...su cosa dovrei focalizzarmi allora???
e poi...ho trovato per omologia queste sequenze...se voglio costruirmi un albero filogenetico con quali sequenze me lo costruisco???
e se voglio una ricerca di iterazioni...dopo una normale interrogazione con blastP quali sequenze dovrei scegliere oltre la query?


spero in un vostro aiuto!!!!

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