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freckle_gabri
Nuovo Arrivato

margherita
Prov.: Lecco
Città: Lecco


4 Messaggi
Inserito il - 31 ottobre 2006 : 23:04:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di freckle_gabri  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di freckle_gabri Invia a freckle_gabri un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
cos'è il fold change riferito al microarray?!
grazie...
"La nostra vita comincia a finire il giorno in cui diventiamo silenziosi sulle cose che contano" (Martin Luther King)

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 01 novembre 2006 : 00:21:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Fold change vuol semplicemente dire "numero di volte".

Ad es. se il tuo controllo ha un valore di 4 e il trattato ha valore 20 il tuo fold change sarà 5 (cioè il trattato è 5 volte il controllo).

Nei microarray suppongo sia il rapporto fra le intensità di un certo spot fra due gruppi sperimentali, ma non sono un esperto di microarray
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LaFra
Nuovo Arrivato

Prov.: Lecco
Città: Lecco


4 Messaggi
Inserito il - 01 novembre 2006 : 12:01:17  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di LaFra  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di LaFra Invia a LaFra un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ma come fanno a venire valore negativi di fold?
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi
Inserito il - 01 novembre 2006 : 18:25:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
perchè il fold change è un rapporto tra le due intensità come ha detto chick, ma in genere viene espresso come logaritmo (di solito log2) quindi se il rapporto è inferiore a 1 il log sarà negativo!

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freckle_gabri
Nuovo Arrivato

margherita

Prov.: Lecco
Città: Lecco


4 Messaggi
Inserito il - 02 novembre 2006 : 09:02:38  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di freckle_gabri  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di freckle_gabri Invia a freckle_gabri un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie...è che ho qualche difficoltà con un articolo e mi sta mandando in confusione tutto!!
"La nostra vita comincia a finire il giorno in cui diventiamo silenziosi sulle cose che contano" (Martin Luther King)
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LaFra
Nuovo Arrivato

Prov.: Lecco
Città: Lecco


4 Messaggi
Inserito il - 02 novembre 2006 : 09:45:17  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di LaFra  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di LaFra Invia a LaFra un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie mille per la risposta!!
ciaociao
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