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DONALD DUCK
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
 Inserito il - 17 giugno 2011 : 17:59:00
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vorrei gentilmente sapere a che cosa è dovuto il solco maggiore del dna cioe perche si forma insieme al solco minore, e perche gli attivatori trascrizionali con dita di zinco interagiscono con esso invece gli omeodomini si legano al solco minore?...........cmq le iterazioni tra gli amminoacidi dei domini avvengono con le basi? sono solo legami ad idrogeno ?............grazie anticipato
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Geeko
Utente
Città: Milano
1043 Messaggi |
Inserito il - 17 giugno 2011 : 19:14:06
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La presenza di due solchi, di diverse ampiezze, è dovuta a quanto ne so alla struttura chimica stessa del DNA e in particolare all'asimmetria dei nucleotidi e al modo in cui si appaiano tra loro col base-pairing.
Io me lo immagino così: se prendi una cintura e le imprimi una torsione alle estremità, otterrai una struttura ad elica con due solchi uguali. Se invece immagini di schiacciare la cintura lateralmente, avrei una faccia concava e l'altra convessa a mo di "C" in sezione  ; se ora le imprimi di nuovo la torsione ottieni due solchi diversi, uno grande (sulla faccia convessa) e l'altro minore (sulla concava).
Ora, da qui a passare alla chimica ci vuole solo un po' di fantasia XD
Guarda questa immagine  :
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DONALD DUCK
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 18 giugno 2011 : 18:26:41
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ma la asimmetria è dovuta a diverse conformazioni che il ribosio puo assumere oppure al fatto che le basi per poter interagire al fine di determinare il massimo abbassamento dell energia determinano tale disposizione tale da formare 2 solchi? sul fatto degli attivatori qualc sa quacosa  |
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Geeko
Utente
Città: Milano
1043 Messaggi |
Inserito il - 19 giugno 2011 : 15:39:51
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| L'asimmetria credo derivi proprio dall'appaiamento delle basi, la cui struttura "forza" la formazione dei due solchi. Di certo le interazioni di una qualunque proteina che riconosce una sequenza consensus specifica avverranno tra amminoacidi e basi (ovviamente non con un rapporto 1:1 ma con interazioni più complesse). La maggior parte delle DNA binding proteins interagiscono (di solito con un'alfa elica) a livello del solco maggiore, che è anche quello che espone maggiormente la sequenza delle basi; di solito quando avvengono interazioni col solco minore, queste sono anche accompagnate da un "piegamento" del DNA lungo il suo asse centrale, e questa modificazione spaziale può servire a potenziare le interazioni di altre proteine in quell'intorno. |
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solco maggiore del dna e attivatori trascrizionali
Didattica
