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moni89
Nuovo Arrivato

60 Messaggi

Inserito il - 29 giugno 2011 : 12:30:45

Volevo farvi una domanda sul programma BLAST, per allineare sequenze nucleotidiche e/o proteiche. In particolare blastx serve a confrontare una sequenza nucleotidica (che viene tradotta nelle sei combinazioni possibili di sequenze proteiche) con una sequenza proteica del database. Volevo chiedervi perch� proprio 6?? La dispensa dice che la sequenza nucletodica viene tradotta nelle 6 sequenze proteiche secondo le 6 possibili reading frames, ma questo passaggio non mi � chiaro. Perch� sono 6 e non 3??

Ale_90
Utente Junior

296 Messaggi

Inserito il - 29 giugno 2011 : 12:38:24

Sono 3 cornici di lettura per filamento, per questo ti da la traduzione in sei sequenze proteiche.

moni89
Nuovo Arrivato

60 Messaggi

Inserito il - 29 giugno 2011 : 13:02:14

Diciamo 3 per il filamento senso e 3 per l'antisenso?? Ma per la trascrizione e traduzione non si dovrebbe considerare solo il filamento senso??