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ronnqvist
Nuovo Arrivato
21 Messaggi |
 Inserito il - 03 luglio 2011 : 15:39:01
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perchè se devo calcolare la frequenza allelica devo fare "fratto il totale moltiplicato per DUE???"
mi spiego meglio. ipotizziamo di avere per il genotipo
SS, 29 individui
SA, 2993
AA, 9365
per un totale di 12387 individui osservati.
La frequenza allelica di S sarà
(29*2)+2993 / 12387*2 = 0.1231
ma perche moltiplico per 2 il totale?!?!? anche perchè in altri appunti non moltiplico... quindi nn capisco se sono io a sbagliarmi o è effettivamente così!!!
inoltre, per vedere quanti sono gli individui attesi secondo HARDY WEINBERG per ogni genotipo, è giusto fare, per esempio per il genotipo SS, 0,1231^2 = 0,015 (frequenza genotipica) e poi moltiplicarla per il totale? (0,015 * 12387 = 187) se sì.. perche si fa così????
grazie a tutti :)
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 03 luglio 2011 : 16:29:10
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Citazione:
Messaggio inserito da ronnqvist
perchè se devo calcolare la frequenza allelica devo fare "fratto il totale moltiplicato per DUE???"
mi spiego meglio. ipotizziamo di avere per il genotipo
SS, 29 individui
SA, 2993
AA, 9365
per un totale di 12387 individui osservati.
La frequenza allelica di S sarà
(29*2)+2993 / 12387*2 = 0.1231
ma perche moltiplico per 2 il totale?!?!? anche perchè in altri appunti non moltiplico... quindi nn capisco se sono io a sbagliarmi o è effettivamente così!!!
grazie a tutti :)
E' giusto. Moltiplichi per due il totale per la stessa ragione per cui moltiplichi per due il dato relativo agli SS: perché ogni individuo della popolazione presenta due loci (salvo caratteri sex-linked).
Una controprova della bontà del calcolo puoi averla calcolando prima la frequenza genotipica e poi quella allelica.
Es:
f(SS) = 29/12387 = 0,002
f(SA) = 2993/12387 = 0,242
f(S) = f(SS) + 1/2 f(SA) = 0,123
Nota che di solito comunque si preferisce calcolare la frequenza allelica dal numero di individui, piuttosto che passando per la frequenza genotipica, di modo da ridurre il numero di calcoli e arrotondamenti, che irrimediabilmente rendono il tutto meno preciso. |
So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 03 luglio 2011 : 22:35:41
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Citazione:
Messaggio inserito da ronnqvist
inoltre, per vedere quanti sono gli individui attesi secondo HARDY WEINBERG per ogni genotipo, è giusto fare, per esempio per il genotipo SS, 0,1231^2 = 0,015 (frequenza genotipica) e poi moltiplicarla per il totale? (0,015 * 12387 = 187) se sì.. perche si fa così????
Perché utilizzando il binomio di H-W trovi le frequenze genotipiche, ma se vuoi sapere il numero di individui con quel genotipo nella tua popolazione devi moltiplicarla per il numero di individui totali della popolazione. Ad es. se trovi una frequenza genotipica di 0,1 vuol dire 10%, quindi su 100 individui 10 avranno quel fenotipo, ma se la tua popolazione è di 1450 individui vuoi sapere quanti di questi hanno quel genotipo, quindi 0,1x 1450 = 145 |
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Calcolo frequenze alleliche
