Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 Laboratorio
 Bioinformatica e Biostatistica
 R cluster geni
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

sarasara88
Nuovo Arrivato



21 Messaggi

Inserito il - 04 luglio 2011 : 03:03:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di sarasara88 Invia a sarasara88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve, spero non risulti una domanda sciocca ma sto impazzendo.
Ho un dataset rxc: 98 probeset x 42 tessuti
i tessuti si dividono in 18 di un tipo, 18 di un altro e 6 di un altro tipo ancora.
Dovendo operare un'analsi di classificazione, cosa devo clusterizzare?? lascio la matrice così come è, raggruppando i probesets oppure la traslo facendo così un raggruppamento sui tessuti dei pazienti?
La mia intenzione è quella di valutare i profili genetici e trarre qualche conclusione in merito alle differenze tra tessuti...

Se qualcuno volesse aiutarmi, gliene sarei immensamente grata!

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 04 luglio 2011 : 08:01:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io farei un clustering della matrice così com'è, SENZA usare il tessuto come classificatore.
A posteriori potrai vedere se effettivamente il clustering ti fa uscire i 3 gruppi di tessuti.

Ricorda sempre che il clustering è un metodo esplorativo, che ti permette di analizzare relazioni fra i tuoi dati: non esiste tuttavia IL clustering corretto.

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina