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 Allineare una sequenza con un "logo"
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Gst
Utente Junior


Prov.: Roma
Città: Ariccia


143 Messaggi

Inserito il - 26 agosto 2011 : 18:55:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gst Invia a Gst un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi

faccio una domanda che, spero, non sia banale!

Ero curiosa di sapere se esiste un server che permetta di allineare una sequenza di nostro interesse con un LOGO (sapete, quelli che vengon fuori da allineamenti multipli e indicano quanto un aa è rappresentato in una data posizione di un dominio, ad esempio).

In questo modo potremmo capire in maniera semplice (relativamente) se la proteina di nostro interesse contiene quel dominio...

P.S. piccolo sfogo: ma perchè non riesco a far funzionare clustalW??? gli dò le sequenze in fasta e mi dice che non le ho inserite oppure che ne devo mettere + di 2... ed erano + di 2!

Ascoltami con gli occhi...
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