Salve a tutti ragazzi/e, mi servirebbe un consiglio sulla tecnica da usare per isolare il 5' di un gene. Ho letto un po in giro e la 5' race classica mi pare la soluzione più semplice quindi vorrei vedere se ho capito bene la tecnica e ottenere qualche informazione sulle possibilità di riuscita perchè vedo un sacco di kit in giro...
allora vediamo se ho capito: 1) retrotrascrivo il mio mRNA usando solo il primer specifico del mio gene 2)degrado l'mRNa rimasto (5min a 85° ? RNase?) 3) purifico il mio cdna (colonnine per purificare l'amplificato tipo quelle promega?) 4)aggiungo la coda di poli C con la terminal transferase 5)faccio una prima PCR anchor primer- primer specifico 1 6) faccio una nested anchor primer- primer specifico 2 più interno
mi affido alla vostra esperienza per conquistare il I esone che essendo composto solo da due amminoacidi nella sequeza genomica non riesco ad individuare..