allineare due sequenze

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claire84
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21 Messaggi

Inserito il - 29 settembre 2011 : 23:47:59

Salve a tutti!
avrei bisogno di alcuni consigli per l'allineamento di due sequenze proteiche, perchè non ho ben capito quale sia il miglior programma da utilizzare a tale scopo. Vorrei allineare la sequenza primaria di due proteine (2 aspartyl proteasi) che probabilmente anche se mostrano una certa somiglianza strutturale non presentano un'elevata similarità a livello di sequenza primaria.

In questo caso ha più senso effettuare un allineamento locale piuttosto che uno globale?

Quale programma mi consigliereste a tale scopo?Uno di questi può andar bene?

http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/

grazie!!