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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
 Inserito il - 20 novembre 2006 : 12:51:19
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Ciao a tutti!volevo sapere come si fa a sapere l'ordine di taglio degli enzimi: ad es.
Bam taglia
0.90
0.20
0.10
l'ordine di taglio è 0.90 0.20 0.10 oppure 0.10 0.20 0.90?grazie mille spero ke qualcuno mi aiuti..
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Ales |
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Anyra
Utente Junior
Prov.: Pesaro-Urbino
Città: Saltara
212 Messaggi |
Inserito il - 20 novembre 2006 : 14:12:24
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Non puoi solo con una digestione e senza conoscere la sequenza.
Ti consiglio di non continuare ad aprire topics sempre sullo stesso argomento, ma di continuare su uno già aperto.
Se aggiungi un nuovo messaggio automaticamente lo trovi sulla prima pagina indipendentemente da chi lo posta.
Se poi in futuro, anche breve, qualcuno avesse bisogno di postare una quest sugli enzimi di restrizione diversa dalla solita : "Dove taglia?" magari non viene visitata. un Po' come la storia di pierino e il lupo.
Ciao |
Il mio Cavaliere
http://s4.battleknight.it/index.php?loc=hire&ref=OTA3NTAw |
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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
Inserito il - 20 novembre 2006 : 15:36:15
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| grazie Anyra!quindi solo avendo la doppia digestione si può conoscere l'ordine!quindi avendo le singole digestioni le doppie digestioni le posso determinare? |
Ales |
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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
Inserito il - 20 novembre 2006 : 16:08:07
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per esempio se abbiamo due enzimi di restrizione:
EcoRI HindIII
6.9 7.9
2.85 1.5
0.25 0.6
qual'è il risultato della doppia digestione Eco/Hind?ciao e scusami per l'insistenza sull'argomento baci |
Ales |
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Fil23
Utente Junior
Prov.: estero
Città: London
238 Messaggi |
Inserito il - 20 novembre 2006 : 18:07:52
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Ciao,
una curosità: ma con 6.9, 7.9 ecc si intende la posizione lungo un frammento nucleotidico espresso in CentiMorgan? |
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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
Inserito il - 20 novembre 2006 : 21:07:52
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| Scusa non l'ho specificato è 6.9 e 7.9 kb! |
Ales |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 20 novembre 2006 : 21:53:44
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Scusa ales, ma come ti ho già detto NON CONTINUARE A POSTARE LA STESSA DOMANDA IN THREAD DIVERSI
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=2354
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=2437
Arrivando alla tua domanda, come ti ho già detto negli altri thread NON lo puoi sapere a priori a meno di non avere già una mappa del DNA o il risultato di una doppia digestione.
Avendo la doppia digestione prendi un foglio di carta e disegni le varie possibilità fino a trovarne una che funzioni... un trucco è quello di guardare frammenti che sono presenti nella singola e nella doppia digestione oppure frammenti della doppia che sono uguali alla somma di frammenti nella singola.
Se scrivi il risultato della doppia digestione in questo esercizio posso spiegartelo meglio.
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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
Inserito il - 20 novembre 2006 : 22:11:00
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Ciao chick80!scusami se ho scritto tante volte lo stesso argomento.. cmq ora sto incominciando a capire qualcosa su questi enzimi..il risultato della doppia digestione
EcoRI/Hind è
6.9
1.25
1.0
0.6
0.25
sapendo ke Eco è 6.9 2.85 0.25
e Hind 7.9 1.5 0.6 grazie x l'aiuto! |
Ales |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 21 novembre 2006 : 06:42:48
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Non fraintendermi, scrivi quante domande vuoi, ma se sono tutte sullo stesso argomento fallo sempre nella stessa discussione, così la cosa non diventa troppo dispersiva.
Per quanto riguarda il tuo esercizio:
tu sai che EcoRI taglia in 2 punti (quindi hai 3 frammenti) e stesso per Hind, ma non sai l'ordine.
Ad es., per EcoRI puoi avere una di queste 3 possibilità
0.25 6.9 2.85
---E-------------E------
0.25 2.85 6.9
---E------E-------------
2.85 0.25 6.9
--------E---E-----------
Nota che le altre combinazioni (es. 6.9 - 0.25 - 2.85) non sono considerate perchè uguali a queste ma lette al contrario.
Puoi fare lo stesso discorso per HindIII
La doppia digestione ti serve per ordinare questi siti di taglio.
Ora, non c'è un modo solo per risolvere questi problemi, ma ti dico come faccio io, poi magari puoi trovare qualche metodo che per te è più comodo.
La prima cosa che farei è prendere il risultato delle singole digestioni e compararlo con quella doppia.
Partiamo da EcoRI: puoi notare è che nella doppia digestione hai ancora il frammento da 0.25 e quello da 6.9 e poi hai 3 frammenti da 0.6, 1 e 1.25 la cui somma guarda caso fa 2.85, cioè la lunghezza del terzo frammento della singola.
Questo ti dice che i due siti Hind sono all'interno del frammento da 2.85. e l'hanno spezzato in quei 3 frammenti più piccoli
Stessa cosa per Hind:
hai ancora un frammento da 0.6, mentre gli altri due non ci sono più. Tuttavia il frammento da 7.9 sarà stato spezzato in 6.9 + 1 e quello da 1.5 in 0.25 + 1.25
Questo ci dice che 6.9 starà vicino a 1 e 1.5 vicino a 0.25. Quindi il frammento da 0.6 starà nel mezzo
Quindi la tua situazione è:
6.9 1 0.6 1.5 0.25
------E----H----H----E------
E questa e l'unica mappa che soddisfa tutte le condizioni!
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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
Inserito il - 21 novembre 2006 : 12:57:21
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è venuto anke a me!Sono troppo felice grazie TANTOspero di non avere più problemi con questi enzimi!bacioni |
Ales |
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taglio enzimi
Didattica
