salve a tutti, una delle domande del test di bioinformatica che ho davanti chiede se è possibile risalire alla struttura primaria di una prteina conoscendone la struttura terziaria, potreste darmi una mano???
Si possono avere alcuni vaghi indizi (es. lì dove avrò beta foglietti probabilmente si trovano aa le cui catene laterali sono ingombranti; nei ripiegamenti conoscendo gli angoli psi e phi è possibile per certi turn dedurre quali siano gli aa coinvolti nel cambio di direzione; si può inoltre inferire che al termine di strutture secondarie come le alfa eliche si trovino proline o asparagine, in grado di rompere lo schema di legami idrogeno ecc) che non permettono nell'enorme maggioranza dei casi (la sola vera eccezione che mi viene in mente è l'informazione data appunto dagli angoli torsionali di certi turn sulla presenza in certe posizioni di glicine o proline) di dire alcunché di preciso sulla natura degli aa coinvolti - cioè sulla struttura primaria.
D'altronde la relazione è bidirezionale: al momento è altrettanto impossibile dalla semplice struttura primaria dedurre quella terziaria, tranne che non si interroghino database in cui sono contentuti i folding di proteine altamente omologhe a quella indagata. In questo caso si può pensare che lo schema di ripiegamento sia simile tra le due sequenze omologhe. Tuttavia è un dato che andrebbe provato cristallizzando la proteina e sottoponendala alla diffrazione a raggi X.
So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today. A Universe From Nothing, Lawrence Krauss