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giovannidimaira
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
 Inserito il - 02 novembre 2011 : 15:00:08
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Ciao a tutti mi chiamo Giovanni Di Maira e lavoro come assegnista presso l'Università di Firenze. Mi occupo in particolare vie di segnale mediate da proteinchinasi. Volevo sottoporre a tutti un quesito : se io ho i dati di 3 esperimenti ad es.: esp. 1. Misurazione A: 2,4,5,8 Misurazione B: 1,4,7,9 esp. 2. Misurazione A: 2,6,7,8 Misurazione B: 1,3,5,9 esp. 3. Misurazione A: 1,4,5,8 Misurazione B: 1,2,6,9. Si tratta di esprimenti indipendenti se voglio calcolare la media dei 3 esperimenti, calcolo la media di ogni esperimento separatamente e poi faccio la media delle medie e poi calcolo l'errore standard ( deviazione standard/ radice quadrato di n=3 in qs caso). Volevo sapere cosa devo fare per valutare la significatività usando per esempio il t-test. Grazie a tutti per l'aiuto.
Giovanni
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 02 novembre 2011 : 15:11:33
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Ciao Giovanni e benvenuto sul forum
Puoi chiarificare un po' l'esperimento?
Le misure sono state fatte sugli stessi soggetti (es. sulle stesse cellule/animali etc.), oppure ogni volta hai ad es. 4 piastre diverse per A e 4 per B oppure solo 4 piastre dove misuri A e B (ma che sono 4 diverse per ognuno degli esperimenti) o ... ?
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giovannidimaira
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
Inserito il - 02 novembre 2011 : 15:18:40
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Ciao,
scusami per la scarsa precisione nella spiegazione. Comunque si tratta di misurazioni fatte sullo stesso campione per ogni esperimento. Nello specifico si parla di analisi di migrazione cellulare, in cui ho 2 condizioni: A e B. Per ogni condizioni conto le cellule al microscopio. In questo caso per ogni condizione conto le cellule che vedo in ogni campo, 4 campi nell'esempio da me riportato ( campo 1: 1 cellula, campo 2: 4 cellule ecc.).
Spero di essere stato un po' più chiaro.
Grazie
Giovanni |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 02 novembre 2011 : 16:24:59
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Allora, in attesa di qualcuno più "statistico" di me, direi che forse il t-test non è il migliore dei test da usare.
Il problema è che hai un fattore di "nuisance" che è la piastra (cioè, i 4 quadrati vengono tutti dalla stessa piastra), ed hai quindi delle misure ripetute. Immagina che il 2o giorno la piastra avesse un problema qualsiasi, avresti delle conte sballate per quelle 4 misure. E' bene quindi utilizzare un test che possa tenere conto di questi effetti.
Così a naso direi di usare un modello log-lineare, qui trovi una spiegazione teorica di cosa sia un modello lineare (puoi probabilmente lasciare un po' perdere il resto della discussione)
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=20326&whichpage=2#92410
Conta però che non sono uno statistico, quindi magari esistono test più corretti da usare. |
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