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Discussione

0barra1
Utente Senior

Citt�: Paris, VII�me arrondissement

3847 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2011 : 17:08:41

Ciao,
ho un quesito da porvi.

Una premessa:
esiste un GWAS in cui si � osservato che uno SNP nel gene BCL11A � associato alla variazione nei livelli di Emoglibina fetale. Tale SNP si trova in un introne (intron 2).

Ora, sto leggendo un articolo di Science in cui si � innanzitutto visto che livelli di BCL11A (mRNA e proteina) variano in funzione di quale nucleotide si trova in questo SNP. Inoltre, quando BCL11A � down-espresso, i livelli di espressione della gamma-globina aumentano. Il che ha fatto pensare, ed � poi stato dimostrato con vari esperimenti, che questo BCL11A sia effettivamente implicato nella regolazione dei livelli di Emoglobina fetale.
Fin qui tutto occhei?

Venendo finalmente al punto, a me interesserebbe sapere se questo SNP � la causa del diverso livello di BCL11A oppure se si tratta solo di uno SNP in linkage disequilibrium con la vera causa della variazione dei livelli di BCL11A. Come posso fare a determinarlo?
E' un'idea sensata quella di sostituire in una linea cellulare che produce alti livelli di BCL11A un nucleotide con l'altro a livello dello SNP per vedere se i livelli di BCL11A diminuiscono? Oppure posso fare un mini-gene assay, portandomi dietro solo exon2-intro2-exon3? Questo secondo approccio mi pare pi� fattibile, ma meno fedele alla realt�.

So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss

Daria85
Utente

678 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2011 : 19:09:29

secondo me si, facendo mutagenesi e clonando le varie varianti di SNP potresti poi fare dosaggi e verificare se lo SNP � associato o � la causa della diversa espressione.