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mastrascia
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20 Messaggi

Inserito il - 28 novembre 2006 : 13:14:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mastrascia Invia a mastrascia un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao ragazzi potreste darmi una dritta...
mi sto incartando nella lettura di un articolo che parla della distinzione del ruolo catalitico e non catalitico di ARGONAUTE 4 nella metilazione del DNA diretta dall' RNA .
Qualcuno ne sa qualcosa a riguardo? gliene sarei infinitamente grato...
Nell'articolo poi fa riferimento a:
CpG
CpNpG
e CpHpH
ma non capisco qual è la differenza tra le 3!
...poi volevo chiedervi un altra cosa:
precisamente cosa si intende tandem affinity purification?
[Laer (Arabidopsis Landsberg erecta transgenic line expressing a tandem affinity purification)]
GRAZIE INFINITE A TUTTI
buona giornata
Juan

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 28 novembre 2006 : 20:52:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Di Argo4 non so nulla...

Le CpG islands sono regioni di DNA caratterizzate da un'alta presenza della sequenza CG (la p sta per phosphodiesther bond) e sono target di metilazione.
Spesso queste sequenze si trovano nei promotori di geni housekeeping dove generalmente non sono metilate, favorendone la trascrizione.
Se invece vengono metilate, la trascrizione viene soppressa.

Nonostante le CpG siano il maggior sito di metilazione, ci sono stati diversi report anche su metilazione su siti non CpG (es. CpA e CpT), suppongo che le CpNpG siano uno di questi altri siti, dove tra C e G c'è un altro nucleotide.
Non ti so però dare informazioni sulla differenza della metilazione all'uno o all'altro sito.
Stesso dicasi per le CpHpH, dove H sta per A, T o C.

La tandem affinity purification (mi sa che il titolo che hai messo è sbagliato... non ha molto senso così) è un metodo di purificazione di complessi proteici.

Vedi:
http://www.cellmigration.org/resource/discovery/ginsberg_tap_appr.shtml <- spiegazione con schemino!
Tandem affinity purification tagging of fatty acid biosynthetic enzymes in Synechocystis sp. PCC6803 and Arabidopsis thaliana.
An alternative tandem affinity purification strategy applied to Arabidopsis protein complex isolation.

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