AliBaBa e la ricerca di interazioni tra proteine

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dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 19 dicembre 2006 : 12:01:52

hola,
che ne pensate di questo tool: http://alibaba.informatik.hu-berlin.de/ ?
Lo sto provando ora e non mi sembra male. E' un programma scritto in Java che analizza automaticamente la letteratura da pubmed e la organizza in un grafo, in modo da visualizzare una rete di interazioni di una proteina creata grazie al data-mining.

Peccato che mi sembri pi� portato allo studio di proteine, altrimenti mi sarebbe stato pi� utile... per� magari a qualcuno di voi pu� interessare. como os parece?

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

MariBi
Utente Junior

170 Messaggi

Inserito il - 19 dicembre 2006 : 13:44:39

Ma graziee!!!

Indovina nella riunione di stamattina io e il mio gruppo che problema ci siamo posti? le reti d'interazione delle proteine e le organizzazioni in grafo!!! Che combinazione!

Inizio a studiarlo da subito! Thanks a lot!

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 19 dicembre 2006 : 14:03:47

ottimo!
Forse ti pu� essere utile anche il database string (http://string.embl.de), che dovrebbe fornirti risultati pi� curati, e se la tua proteina � di uomo, ratto o topo puoi usare anche http://harvester.embl.de .