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Athena1Arcadica
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4 Messaggi |
 Inserito il - 05 maggio 2012 : 14:18:15
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Salve a tutti,
io avrei un problema col riconoscimento di alcuni esoni. Vi spiego brevemente cosa dovrei fare:
Il mio professore ha dato 3 sequenze:
- Un DNA genomico umano
- Un cDNA di mouse che codifica per la betaglobina
- Un cDNA di uomo che codifica per la betaglobina
Nell'esercitazione chiede un metodo per trovare con il minor numero di errori possibili, il numero di esoni e la loro locazione.
Premetto che le mie conoscenze di Bioinformatica sono molto ridotte, ma io avevo pensato di utilizzare un programma di predizione tipo GeneScan e vedere quanti esoni trovava... e poi magari compararlo con un Browser genomico tipo Ensembl
Il dubbio però mi sorge quando in GeneScan io non posso comparare il DNA genomico con uno dei due cDNA quindi mi servirebbe gentilmente un consiglio!
Grazie a tutti...
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Problema col riconoscimento di esoni
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