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 Differenza tra linkage e linkage disequilibrium
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MCV91
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106 Messaggi

Inserito il - 02 luglio 2012 : 10:12:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di MCV91 Invia a MCV91 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ho provato a vedere se trovavo qualcosa nel forum attraverso "cerca", ma niente! Qual Ŕ la differeza tra il linkage normale ed il linkage disequilibrium?? C'Ŕ differenza??
Mi piacerebbe sapere anche la differenza tra loro per quanto riguarda i test di suscettibilitÓ.
Grazieee

Gr÷n
Utente Junior



218 Messaggi

Inserito il - 02 luglio 2012 : 15:48:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gr÷n Invia a Gr÷n un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao,

questo Ŕ uno degli argomenti che mi lascia pi¨ perplesso, anche se credo d'essermi fatto un'idea. Dovresti provare a fare una ricerca personale su Google, se sul testo non trovi nulla.

Ad ogni modo, ti dir˛ quel che finora ho compreso.

Il linkage Ŕ "semplicemente" sinonimo di geni associati. Quindi, due geni (o meglio, due alleli sintenici di uno stesso cromosoma) sono in linkage quando tendono ad essere ereditati assieme - e a non assortire indipendentemente, come invece accade nel caso di geni non associati.

Rivedi la questione delle mappe di associazione, la frequenza di ricombinazione come stima della distanza su mappa genica statistica.

_

Il linkage disequilibrium dovrebbe invece esprimere una tendenza di due geni ad essere ereditati assieme (anche in seguito ad eventi di crossing over) pi¨ alta del normale. Ossia, pi¨ alta di quanto ci si sarebbe aspettati dalle frequenze di ricombinazione di quei geni.

Il linkage disequilibrium, da quel che ho letto, pu˛ addirittura far si che due geni che formalmente NON APPAIANO linked (ossia, distanti oltre 50cM oppure addirittura su cromosomi DIFFERENTI) vengano di fatto ereditati sempre assieme.

Di fatto, due geni in linked disequilibrium su cromosomi diversi non figurano "in linkage", perchÚ i principi del linkage son quelli che conosci anche tu, studiando un qualsiasi capitolo sui Geni Associati.

Come vedi la differenza c'Ŕ eccome!

Qui qualche idea: http://www.animalgenome.org/edu/QTL/Julius_notes/05_linkagemap.PDF

Nel disequilibrium entrano in gioco "fattori altri" che fanno si che questi due geni vengano ereditati molto spesso assieme. Tra questi fattori altri rientra un discorso biochimico-funzionale - ex. un gene per poter funzionare ha bisogno dell'altro e l'organismo ne tiene conto.

____

Altro ancora qui: http://www.madsci.org/posts/archives/2000-12/977419180.Ge.r.html

____

Comunque son in dubbio almeno quanto te quindi aspetter˛ volentieri una risposta.



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MCV91
Nuovo Arrivato



106 Messaggi

Inserito il - 03 luglio 2012 : 12:59:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di MCV91 Invia a MCV91 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao Gron! Ti ringrazio per la tua spiegazione, l'argomento mi Ŕ giÓ un p˛ pi¨ chiaro!
Aspettiamo comunque altri pareri
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