Ad importare il DB intero in un solo colpo non saprei. Quando l'avevo fatto io per topo e uomo ricordo che mi selezionavo le tabelle che mi servivano. Su UCSC ogni tabella è corredata da un file di dati compresso gz più uno script SQL per generarla. Qui c'è uno script di esempio (non so i comandi specifici per PostGre però):
#!/bin/sh
cd /media/sdb6/ensembl_DBs/mus_musculus/mus_musculus_core_50_37c;
pwd;
echo;
mysql -u dario mus_musculus_core_50_37c < mus_musculus_core_50_37c.sql;
echo "creazione tabelle completata!";
mysqlimport -u dario mus_musculus_core_50_37c -L *.txt;
echo "popolamento DB completato!";
Postgress e Postbio
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Inserito il - 20 settembre 2012 : 23:33:51
