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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 27 settembre 2012 : 13:51:06
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Sto cercando, invano, sul PDB strutture di anticorpi interi. Finora ne ho trovati solamente 3 (1IGT, 1IGY, 1HZH) e piuttosto datati, potreste aiutarmi nella ricerca???
gotta catch em all!!!
P.S.: astenersi quei perditempo di modelli, solo cristalli please
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 27 settembre 2012 : 17:12:16
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Mmmmm anticorpi interi non saprei! Ho idea che non ce ne siano molte, ma non saprei neanche aiutarti più di tanto. Prova a vedere se questa pagina ti può essere utile, sempre ammesso che tu non l'abbia già trovata: http://tinyurl.com/crjckml |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 27 settembre 2012 : 17:28:43
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ah, la cricca del KabatMan... la conosco! Ho usato la loro nomenclatura Chotia improved per il mio progetto. Utilissima, la sto spulciando infatti. Intanto, se non hanno trovato un altro impiego, spero che gli autori di quelle tre strutture mi rispondano se sono a conoscenza di altre strutture recenti. |
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AleXo
Moderatore
Prov.: Estero
Città: San Francisco, California
1550 Messaggi |
Inserito il - 27 settembre 2012 : 19:52:09
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la maggiorparte delle volte cristallizzano fab e basta |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 28 settembre 2012 : 09:58:07
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Citazione: Messaggio inserito da AleXo
la maggiorparte delle volte cristallizzano fab e basta
già, purtroppo io ho bisogno di Ab interi visto che dovrei analizzare hinge e interazioni tra Fab e Fc. Preferirei evitare di costruirmi modelli, che a questo livello lasciano un po' il tempo che trovano. Già dovrò introdurre forti limitazioni (es. trascurare la porzione glicosilata)... |
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AleXo
Moderatore
Prov.: Estero
Città: San Francisco, California
1550 Messaggi |
Inserito il - 28 settembre 2012 : 17:48:51
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penso che sia proprio la flessibilita' dell'hinge e dintorni a causare problemi nel cristallizzare full igg |
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