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ManuBeasy
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18 Messaggi

Inserito il - 21 novembre 2012 : 16:26:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ManuBeasy Invia a ManuBeasy un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao

Non so se questa sia o meno la sezione adatta ma vedo che una sezione di "pura" chimica non c'è...

Sto seguendo un corso di sintesi di oligonucleotidi in fase solida. Sono in difficoltà circa la deprotezione di oligomeri di RNA.
Il mio oligomero lo proteggo col Cianoetile al 3' mentre al 2' proteggo solitamente con TBDMS o derivati in cui è appunto presente una funzione eterea al silicio. Il gruppo al 3' (quindi il cianoetile) è rimuovibile in condizioni basiche mentre il TBDMS va via in presenza di ioni fluoruro.

Ora nella reazione di distacco, perché devo trattare prima con ammoniaca e poi con THF (ioni fluoruro es.) e non viceversa?
E' questo step che non mi è chiaro
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