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 problema con modello di markov
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biomanutech
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Inserito il - 12 dicembre 2012 : 12:06:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di biomanutech Invia a biomanutech un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi, stavo studiando per l'esame di Bioinformatica ma mi stavo un po' incasinando visto che il libro è molto conciso e più che risolvere dubbi li crea.
Detto questo, io ero alle prese con il modello di Markov..ho capito che descrive i casi in cui la probabilità di un evento dipende da quello che lo precede e per questo viene usato per capire se una sequenza contiene ad esempio effettivamente una giunzione introne-esone, ma è come se mi mancasse un esempio pratico, cioè:
come me la costruisco la matrice?
in teoria calcolando la delle coppie d basi a partire da regioni che so avere x certo questa giunzione intone-esone, giusto?
per cui mi chiedo:la frequenza con cui compare la coppia AG al 3' di un introne non dovrebbe essere 1?
Sento che c'è qualcosa che mi sfugge, il libro non fa nemmeno un esempio purtroppo!
Grazie a chi mi risponderà, anche se non so se sono stato molto chiaro ...
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