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Bimbagioia
Nuovo Arrivato
Cittā: Torino
70 Messaggi |
 Inserito il - 08 marzo 2013 : 17:02:26
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Ciao a tutti,
qualcuno di voi saprebbe spiegarmi come faccio a determinare i costi nell'allineamento di sequenze, per avere il percorso a minor/maggior costo?
il match=0; mismatch=20; ins/del= 25,ora in una ipotetica seq ATG e GGAATGG, come determino il costo? Nelle caselline con che criterio inserisco i costi?
Mi sono spiegata malissimo ma non ho la minima idea di come funziona l'argomento, quindi scusate l'ignoranza anche nell'italiano
Grazie a tutti, se c'č qualcuno che sa chiarirmi lo ringrazio molto
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daleth
Nuovo Arrivato
11 Messaggi |
Inserito il - 30 marzo 2013 : 20:00:48
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| Programmazione dinamica? Visto che č passato del tempo ti chiedo prima se sei ancora interessata ad una spiegazione. |
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Bimbagioia
Nuovo Arrivato
Cittā: Torino
70 Messaggi |
Inserito il - 31 marzo 2013 : 17:05:52
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| ciao! si grazie,sarei ancora interessata! |
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daleth
Nuovo Arrivato
11 Messaggi |
Inserito il - 01 aprile 2013 : 17:27:37
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Qui ho trovato una buona spiegazione, se non ti torna qualcosa chiedi pure.
http://www.avatar.se/molbioinfo2001/dynprog/dynamic.html
Comunque, in estrema sintesi, per ogni casella devi scegliere tra le tre possibili soluzioni (ovvero, allineare le due basi, inserire un gap nella prima sequenza o inserire un gap nella seconda sequenza) quella che ti fa ottenere il miglior punteggio. |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Cittā: Monza
1303 Messaggi |
Inserito il - 02 aprile 2013 : 09:03:17
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| Ah, la programmazione dinamica! A parte gli algoritmi di allineamento, di ottimizzare il resto in moneta e di calcolo del fattoriale per me č sempre stato arduo formalizzare i problemi in termini di programmazione dinamica :-D Se qualcuno ha degli appunti di "strategie" e algoritmi per programmare in modo dinamico gliene sarei grato |
http://www.linkedin.com/in/dariocorrada |
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