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viggy
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41 Messaggi

Inserito il - 17 marzo 2013 : 19:20:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di viggy Invia a viggy un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sapreste dirmi perchè la conformazione preferita dello zucchero in caso di duplex di RNA ( o DNA disidratato) è la c3'-endo?

Esame imminente di biologia molecolare

grazie a tutti!

Grön
Utente Junior



220 Messaggi

Inserito il - 18 marzo 2013 : 17:13:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Grön Invia a Grön un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao,

posso immaginare che nel caso dell'RNAduplex, non convenga proprio giocare sul carbonio 2 (di solito le conformazioni pucker interessato il C2 o il C3) perché, portandosi un ossigeno (dell'ossidrile 2'-OH) potrebbe creare un ingombro eccessivo nella conformazione pucker.

Anche per il DNA -A (ambiente povero d'acqua) è il C3' endo. Non so spiegarti con certezza il motivo, però. Probabilmente, se è il C3' ad essere "spinto" fuori dal piano dell'anello, l'angolazione della coppia di basi risulterà differente e più "adatta" alla struttura disidratata che caratterizza il DNA. Ma è una spiegazione molto dozzinale.

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