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 Diminuzione espressione genica ma no metilazione
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Shiva11_83
Nuovo Arrivato



42 Messaggi

Inserito il - 05 aprile 2013 : 15:42:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Shiva11_83 Invia a Shiva11_83 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi! mi potete dare una mano su un piccolo enigma?
sto valutando l'espressione genica di alcuni geni mediante qRT-PCR e relativa metilazione del promotore. Per alcuni geni ho visto un andamento dell'espressione corrispondente al loro livello di metilazione (ovvero, più diminuiva l'espressione genica, aumentava il livello di metilazione, e viceversa). Per altri geni questo non avveniva; per esempio avevo una diminuzione dell'espressione genica a fronte di una metilazione praticamente assente. Mi sono chiesta quali sono i meccanismi alternativi alla metilazione che possono causare un silenziamento genico. Me ne sono venuti in mente alcuni:
1) presenza di siRNA per quel gene
2) modificazioni istoniche
3) alterazioni a livello cromatinico
4) localizzazione del gene a livello nucleolare (qua andiamo un pochino nella fantascienza)....

altro?? ho l'impressione che mi sfugga qualcosa.... grazie mille!!

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 05 aprile 2013 : 16:46:37  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
1) Diminuzione di un fattore di trascrizione per quel gene
2) Aumento di un fattore che inibisce la trascrizione del gene
3) Cambiamento dei livelli di qualche ormone

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domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1723 Messaggi

Inserito il - 07 aprile 2013 : 20:15:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
n) Variazioni della degradazione/stabilizzazione di quegli mRNA

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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Shiva11_83
Nuovo Arrivato



42 Messaggi

Inserito il - 08 aprile 2013 : 15:54:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Shiva11_83 Invia a Shiva11_83 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da domi84

n) Variazioni della degradazione/stabilizzazione di quegli mRNA



a questo ci avevo pensato anche io, ma mi ero dimenticata di scriverlo nel mio post.. ma grazie mille comunque per le vostre risposte :)
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Patrizio
Moderatore

mago

Città: Vancouver


1900 Messaggi

Inserito il - 08 aprile 2013 : 17:03:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ci sono anche sistemi che regolano l'espressione genica attraverso lo splicing, ad esempio l'NMD ( nonsense-mediaeted mRNA Dacay)
oppure sistemi in cui sono coinvolti i fattori di traduzione del messaggero, ad esempio come accade per la sintesi di GCN4,
anche l'ubiquitina ha un ruolo nella regolazione dell'espressione genica


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