Sto studiando una proteina di cui č nota la sequenza amminoacidica e la struttura cristallina.
Mi interesserebbe sapere se esistono programmi free e user friendly per provare a vedere se in base alla sua sequenza/struttura potrebbe legare altre proteine ed eventualmente promotori genici (DNA) o addirittura RNA.
Credo che prima di tutto dovresti conoscere quali partner lega la tua proteina. In letteratura potresti trovare qualche indizio, visto che hanno depositato giā un cristallo della proteina.
Di programmi free che fanno docking ce ne sono (il primo che mi viene in mente č autodock), che siano user friendly dipende dal tuo grado di esperienza in questo campo.
Comunque, se cerchi sul forum troverai un mucchio di discussioni giā sviluppate sul tema.
P.S.: per favore, evita di duplicare lo stesso thread...
Grazie mille dell'indicazione. Adesso vedo di impratichirmi nella "navigazione" nei forum di discussione che sono giā in itinere. Grazie ancora. Chiara11