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elenute
Nuovo Arrivato

1014_da_paolaromeo
Cittā: trieste


10 Messaggi
Inserito il - 13 agosto 2013 : 10:14:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di elenute Invia a elenute un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Vorrei trovare un programma che mi dicesse, una volta inseriti i miei primer, tutti i possibili prodotti che si ottengono in seguito ad una PCR e con che probabilitā li ottengo (partendo da cDNA umano). In questo modo posso sapere quali possibili bande ottengo oltre alla mia proteina di interesse. Grazie

domi84
Moderatore

Smile3D

Cittā: Glasgow


1724 Messaggi
Inserito il - 21 agosto 2013 : 18:44:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Questo dovrebbe fare al caso tuo...
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/
Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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elenute
Nuovo Arrivato

1014_da_paolaromeo

Cittā: trieste


10 Messaggi
Inserito il - 21 agosto 2013 : 19:08:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di elenute Invia a elenute un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ho usato proprio quel programma per disegnare i primer..volevo sapere se esiste qualche altro programma che mi desse anche la probabilitā o la percentuale di trascrizione di altri frammenti in modo da sapere se la banda che vedo č la mia oppure č un altro frammento che ha un'alta probabilitā di trascrizione con quei primer. Grazie comunque
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domi84
Moderatore

Smile3D

Cittā: Glasgow


1724 Messaggi
Inserito il - 22 agosto 2013 : 13:47:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Se i tuoi primer annilassero in un altro punto con una percentuale abbastanza alta, primer blast te lo direbbe. Ovviamente rispettando le temperature di annealing indicate.
Ciao!
Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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stefanken
Nuovo Arrivato



39 Messaggi
Inserito il - 29 agosto 2013 : 15:17:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di stefanken Invia a stefanken un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao,
io posso segnalarti anche in-silico PCR dell'UCSC.
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr?command=start
Lo trovo piuttosto comodo.
Saluti
Stefano
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