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Valentina B.
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15 Messaggi

Inserito il - 14 novembre 2013 : 20:33:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Valentina B. Invia a Valentina B. un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao!

Il modulo di lettura pi¨ probabile Ŕ quello che ha un codone di stop il pi¨ tardi possibile o conta anche quanti codoni di stop ci sono nella sequenza considerata? o un mix di entrambe?
Facendo un esempio un po' estremo: una sequenza di 20 codoni:

modulo di lettura 1: ha un codone di stop al 10░ codone
2: due codoni di stop a 11░ e 12░ codone
3: tre codoni di stop a 12░-13░ e 14░ codone



Un'altra cosa: almeno nei procarioti, individuato il codone AUG con la sequenza SD, posso ipotizzare non serva individuare la ORF, visto che quella giusta mi Ŕ giÓ data dal codone di start.
Perci˛, domanda: la determinazione della ORF Ŕ solo un espediente per quelle date sequenze che non comprendono -ahimÚ- il codone di start e la sequanza shine-delgarno?
Quando devo determinare l'ORF di una qualsiasi sequenza, e la scelgo, quell'ORF Ŕ solo un'ipotesi col 66% di probabilitÓ di essere sbagliata, o Ŕ certezza?


Grazie!
Spero non le consideriate domande troppo stupide per dargli risposta.
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