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AntonioSillo
Nuovo Arrivato

61 Messaggi

Inserito il - 18 gennaio 2014 : 15:05:46

Salve ragazzi,
vorrei sapere se � possibile trovare il file .pdb del frammento di b-DNA dove c'� il promotore della SOD3 5'-GAAAAGAAAAGGCCCTTCGAGAAAGAGAC-3', o se � possibile da questa sequenza oligonucleotidica prevedere la struttura 3D del double strand di b-DNA in formato .pdb. Che programmi dovrei utilizzare?
Grazie!

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 19 gennaio 2014 : 10:51:38

Per le strutture cristallografiche potresti provare a fare un blast della tua sequenza contro il Protein Data Bank.

Poi non ho idea di come e quanto le tecniche di homology modeling siano trasferibili agli acidi nucleici.

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada