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 Alcune "N" nella sequenza genomica e negli SSR...
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Tag   DNA    primers  Aggiungi Tag

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Lia79
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Inserito il - 21 novembre 2014 : 16:28:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Lia79 Invia a Lia79 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao!

Sto analizzando una sequenza genomica di DNA vegetale divisa in contigs e devo evidenziare microsatelliti per poi disegnare primers per analisi di frammenti. Ora mi capita di trovare alcune "N" sia nella sequenza che all'interno del microsatellite (Esempio nel microsatellite: ACACACACACACANNACACACACAC...). Come comportarmi? Posso usare quei microsatelliti per disegnare primers? o le "N" rendono impossibile usarli? E le "N" nelle regioni fiancheggianti influenzano l'eventuale disegno di primers?

Grazie!!!
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