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Tag   Dendrogrammi    Analisi SSR    Filogenesi  Aggiungi Tag

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Kika_Yeah
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5 Messaggi

Inserito il - 08 maggio 2015 : 17:28:20  Mostra Profilo Invia a Kika_Yeah un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Cari tutti,

alla fine della fiera, ho finito la mia SSR analysis ottenendo anche buoni risultati.
Ho costruito un dendrogramma basato sul coefficiente di NEI e analisi UPGMA. Ma i valori di bootstrap sono... coem dire... farlocchi... Troppo bassi... con degli zeri.Ed ho usato 1000 repliche per la bootstrap analysis...

Eppure i dati sono buoni... Non so come risolvere. Ho cambiato analisi (da UPGMA a neighbour Joining) e diverse distanze genetiche. Ma la robustezza dei Nodes è pessima...

idee? Suggerimenti da chi ha più esperienza?

Ah, il dendrogramma è stato costruito con Population e visualizzato con FigTree...

Help please...
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