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Tag   Bioinformatica    allineamenti    allineamenti globali    allineamenti locali    algoritmi dinamici    algoritmi euristici  Aggiungi Tag

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silvana90
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105 Messaggi

Inserito il - 21 maggio 2016 : 17:11:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di silvana90 Invia a silvana90 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve Ragazzi!

Ho dei dubbi riguardo agli algoritmi dinamici ed euristici.

Allora, innanzitutto gli algoritmi dinamici utilizzano allineamenti globali o locali, o entrambi? Una sequenza viene prima allineata localmente e poi globalmente o viceversa?

invece, gli algoritmi euristici utilizzano allineamenti locali, globali o entrambi?

Poi non ho capito perché gli algoritmi dinamici sono più lenti rispetto agli euristici, cioè quelli dinamici sono più lenti perché appunto essendo preciso confronta ogni singolo aminoacido identico(se parliamo di una sequenza proteica)considerando anche le indel? o le indel non vengono considerate?

quelli euristici invece sono più veloci oltre perché sono approssimativi ma anche perché cerca rapidamente le zone di massima identità tra due sequenze?

grazie in anticipo a chi risponderà


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