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Crick82
Utente Junior



139 Messaggi

Inserito il - 30 marzo 2007 : 11:12:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Crick82 Invia a Crick82 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi, ho sostenuto l'esame di bioinformatica da un po' e ho già dimenticato alcuni dei siti utili per l'analisi bioinformatica di una sequenza nucleotidica ma anche proteica.
Mi potete gentilmente elencare quali sono i siti che permettono:
1) Allineare 2 sequenze nucleotidiche
2) Confrontare la propria sequenza nucleotidica con quelle in banche dati.
3) Cercare l'ORF nella propria sequenza
4) Prevedere il tradotto data la sequenza nucleotidica
5) Allineare 2 sequenze amminoacidiche

Vi ringrazio anticipatamente.

Fil23
Utente Junior

gatto

Prov.: estero
Città: London


238 Messaggi

Inserito il - 30 marzo 2007 : 11:56:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Fil23  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Fil23 Invia a Fil23 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao.
1) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl2seq/wblast2.cgi
2) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
3) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
4) http://expasy.org/tools/dna.html
5) http://www.ch.embnet.org/software/LALIGN_form.html
cao ciao
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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 30 marzo 2007 : 23:34:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao,
ho spostato l'altro messaggio in un altro topic (http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=3393), mi sembrava più chiaro.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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Crick82
Utente Junior



139 Messaggi

Inserito il - 06 aprile 2007 : 18:59:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Crick82 Invia a Crick82 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Mi potete indicare anche il sito che permette di ottenere la sequenza complementare a quella immessa?
Grazie
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