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gecotto
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8 Messaggi

Inserito il - 28 giugno 2016 : 19:53:22  Mostra Profilo Invia a gecotto un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao il mio dubbio è: visto che le proteine migrano in base al peso molecolare dopo essere state denaturate come possiamo identificarle con gli anticorpi visto che hanno perso la struttura nativa?

GFPina
Moderatore

GFPina



8329 Messaggi

Inserito il - 06 luglio 2016 : 18:41:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Gli anticorpi che "funzionano" in Western Blot non riconoscono necessariamente la "proteina nativa".
Ogni anticorpo di per sé "vede" la proteina (antigene) in modo diverso, ci sono anticorpi che riconoscono una certa sequenza, anticorpi che riconoscono una certa struttura ecc...
Ad es. un anticorpo che vede una certa sequenza che nella proteina foldata si trova all'interno della struttura, funzionerà magari molto bene in Western Blot, ma non funzionerà in altri test nei quali si utilizza la proteina nativa, ad es. in ELISA o in cromatografia di affinità. Viceversa un anticorpo che riconosce una determinata struttura formata da due porzioni della proteina che risultano distanti nella sequenza, ma sono invece vicine nella proteina foldata, funzionerà bene con la proteina nativa, ma non sarà in grado di riconoscerla se la denaturi.
Anche nello stesso Western Blot a secondo delle condizioni che utilizzi, ad es. riducenti o non riducenti l'anticorpo può riconoscere o meno la proteina.
Ovviamente poi ci sono anche anticorpi che sono in grado di vedere sia la proteina nativa che quella denaturata.
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