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 Associazione genica: frequenze e mappa dei geni
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elemanci
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Inserito il - 04 dicembre 2016 : 12:00:59  Mostra Profilo Invia a elemanci un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Ciao ragazzi, avrei bisogno che qualcuno mi spiegasse lo svolgimento di questo esercizio di cui ho gia la soluzione ma non riesco a capire dei passaggi!
L'esercizio è il seguente:

Nella Drosophila melanogaster sono presenti tre geni che chiameremo x, y e z, ognuno dei quali ha un allele mutante recessivo rispetto all'allele selvatico. Da un incrocio tra maschi selvatici e femmine eterozigoti per questi tre loci si sono ottenuti questi risultati:
Femmine: +++ 999 Maschi:
+++ 37
+yz 33
x++ 26
++z 435
xy+ 439
xyz 32
Basandoti sui dati riportati, ricostruisci una mappa di associazione dei tre geni e calcola il coefficiente di coincidenza.


E questa è la soluzione che mi danno:

La prima cosa che salta all'occhio dal risultato di questo incrocio è che abbiamo 999 femmine tutte wild type e 1002 maschi con vari fenotipi: questo dato sta ad indicare che i tre geni presi in esame sono localizzati sul cromosoma X: infatti come risultato fenotipico, le femmine nate hanno ereditato il cromosoma X del padre che possiede tutti e tre i geni wild type.
Stabilito questa prima verità, identifichiamo i due genotipi parentali: essi corrispondono ai fenotipi dei maschi più rappresentati, in quanto i maschi di Drosophila possiedono un corredo cromosomico di tipo X Y e il cromosoma X è ereditato per forza dalla madre. Essi sono quindi:

++z 435 e xy+ 439

Basandoci sulle due classi parentali, analizziamo ora le frequenze di ricombinazione fra i tre loci utilizzando la classica formula:

FR = Numero di ricombinanti fra i due loci / numero totale individui


NOTA BENE: in questo esercizio il totale degli individui da prendere in esame è solo quello dei maschi! Bisogna ignorare del tutto le femmine nel calcolo per l'ovvio motivo che in esse il cromosoma ereditato è l'unico cromosoma X del padre.
FR fra x e y = 33 + 26 / 1002 = 0.0588 = 5,88 um (unità di mappa) FR y e z = 32 + 26 +33 + 27 / 1002 = 0.117 = 11,7 um
FR fra x e z = 37 + 32 / 1002 = 0.068 = 6,8 um
A questo punto, grazie a questi dati, scriviamo la mappa genica:


Z____6.8um____X____5.88um____Y


Resta da calcolare il coefficiente di coincidenza, che è uguale a:
Frequenza dei doppi ricombinanti osservati / frequenza dei doppi ricombinanti attesi.
Nel nostro caso osserviamo zero doppi ricombinanti quindi il coefficente di coincidenza è ZERO!
L'interferenza, uguale a 1 - cc è quindi uguale a 1.


Ciò che non riesco a capire è:
- con che criterio hanno scelto i ricombinanti per calcolare le varie frequenze
- come si fa a capire la posizione dei geni: solitamente faccio il confronto tra doppi ricombinanti e parentali ma in questo caso non avendo i doppi ricombinanti non posso farlo!

Grazie in anticipo :)

elemanci
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8 Messaggi

Inserito il - 06 dicembre 2016 : 12:09:28  Mostra Profilo Invia a elemanci un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ragazzi per favore aiutatemi non riesco proprio a capire come fare il passaggio fondamentale e tra poco ho l'esame
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elemanci
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8 Messaggi

Inserito il - 06 dicembre 2016 : 12:41:22  Mostra Profilo Invia a elemanci un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Svolgendo l'esercizio ciò che non capisco è:
Se io ho la progenie di sei individui, posso individuare i due parentali che in questo caso sono:
++z 435
xy+ 439

A questo punto normalmente individuo i due doppi ricombinanti per fare il confronto con i parentali e cosi trovo l'ordine dei geni. Ma in questo caso non posso farlo non avendo i doppi ricombinanti! Come faccio a capire l'ordine dei geni?
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 06 dicembre 2016 : 18:19:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Non hai provato a cercare esercizi simili?
E' stato spiegato più volte!
ad es. vedi: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=25284

Comunque i "doppi ricombinanti" non li osservi perché sono molto poco frequenti, ma sono le due classi che mancano:
+y+
x+z
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elemanci
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Inserito il - 09 dicembre 2016 : 00:35:07  Mostra Profilo Invia a elemanci un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Grazie mille GFPina! Ma continuò a non capire come faccio a trovare l'ordine dei geni! Scusa sono un po' tarda! Ho guardato l'esercizio di cui mi hai dato il link ma non riesco proprio a comprendere. Se solitamente paragoni i doppi ricombinano con i parentali e faccio lo scambio, come faccio qui?
Grazie mille ancora davvero!
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elemanci
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8 Messaggi

Inserito il - 09 dicembre 2016 : 00:35:31  Mostra Profilo Invia a elemanci un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Ricombinante*
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 12 dicembre 2016 : 12:58:25  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da elemanci

Se solitamente paragoni i doppi ricombinano con i parentali e faccio lo scambio, come faccio qui?


Fai esattamente la stessa cosa! Qual è il problema?
I doppi ricombinanti ti ho detto quali sono!
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elemanci
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8 Messaggi

Inserito il - 12 dicembre 2016 : 16:16:48  Mostra Profilo Invia a elemanci un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si infatti ho fatto la stessa cosa.. ma allora nella soluzione che mi hanno dato c'è un errore, no? Per questo non mi tornava!
Infatti se paragono doppi ricombinanti e parentali ottengo

+y+ xy+
x+z ++z

Quindi guardandoli sposto la x al centro perché è l'unica che cambia.. l'ordine è quindi YXZ.

O sbaglio?
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 12 dicembre 2016 : 19:15:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Infatti, la "X" sta in mezzo! Esattamente come nella soluzione che ti hanno dato!
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elemanci
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8 Messaggi

Inserito il - 13 dicembre 2016 : 11:18:56  Mostra Profilo Invia a elemanci un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da GFPina

Infatti, la "X" sta in mezzo! Esattamente come nella soluzione che ti hanno dato!



Scusami ma pensavo che cambiasse scrivere ZXY e YXZ..
Grazie mille per l'aiuto, gentilissima!
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marta03
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0 Messaggi

Inserito il - 15 gennaio 2017 : 19:15:21  Mostra Profilo Invia a marta03 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Ciao, qualcuno può spiegarmi questi esercizi? Grazie in anticipo :)
In un organismo aploide i loci C e D distano 8 unità di mappa. Si esegue l'incrocio Cd × cD. Dire quali saranno nella progenie le proporsi delle seguenti classi
-CD
-cd
-Cd
- tutti ricombinanti


9) un moscerino della frutta con genotipo BR/br viene sottoposto a testcross con un moscerino br/br . Nel 84% delle meiosi non si formano chiami tra i due geni , che sono associati. Nel 16% delle meiosi invece si forma un chiama. Quale proporsione della progenie sarà Br /br ?

10) un individuo A/A × B/B è incrociato con a/a × b/b e la F1 è sottoposta a testcross. Quale percentuale del testcross sarà a/a × b/b se i due geni sono:
- non associati ?
- completamente associati
-distano 10 unità di mappa
- distano 24 unità di mappa?
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