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Sennar23
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Inserito il - 21 luglio 2017 : 14:30:25  Mostra Profilo Invia a Sennar23 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve ragazzi, sono nuovo, ma vi seguo da tempo e ammiro il vostro lavoro. Per questo vi scrivo, perché sono praticamente disperato. Mercoledì ho l'esame di Genetica molecolare e tra i vari esercizi potrebbe capitare questo:

"Cinque cloni BAC di DNA umano (da A a E) vennero saggiati per la presenza di siti STS, indicati con STS-1 fino a STS-7. I risultati sono riportati nella tabella sottostante, dove un segno + indica che quel BAC contiene l'STS in questione:

BAC 1 2 3 4 5 6 7
A + - + + - + -
B + - - - + + -
C - - + + - - +
D - + - - + + -
E - - + - - - +

Dopo aver descritto la tecnica che consente di stabilire la presenza di una STS all'interno di un clone BAC, disegna la mappa fisica della regione, indicando l'ordine degli STS. Allinea i BAC in un contig e spiega che cos'è un contig".

Ora, so cosa sono gli STS e i contig e fin qui tutto bene. La tecnica credo consista in estrazione del DNA, trascrizione inversa, quindi ottenimento di cDNA e clonaggio in vettori BAC, giusto?
Poi, altra domanda: come stabilisco l'ordine degli STS? Cioè, devo ordinare i cloni in modo che gli STS si sovrappongono. Quindi io ho pensato che l'ordine possa essere A B D C E, perchè A e B si sovrappongono in corrispondenza di 1 e 6, B e D in corrispondenza di 5 e 6, A e C in corrispondenza di 4, C e E in corrispondenza di 3 e 7. Ma non ne sono pienamente sicuro. Cioè, qual è il punto di partenza per stabilire l'ordine degli STS e quindi dei cloni?

Sono ore che cerco praticamente ovunque e sono disperato. Vi prego, aiutatemi!
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