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Remcast
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3 Messaggi

Inserito il - 16 settembre 2017 : 11:14:57  Mostra Profilo Invia a Remcast un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti, avrei bisogno di aiuto con il codice di una proteina: 1A0H.
In base al PDB, ho capito che si tratta di un tetramero.
Come faccio a convertire la sequenza FASTA (che è amminoacidica giusto?)in sequenza nucleotidica?
In più come faccio a fare una ricerca di similarità in BLAST sia per la sequenza aa che nt?
Grazie a tutti quelli che interverranno.

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1724 Messaggi

Inserito il - 16 settembre 2017 : 19:54:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
FASTA è una sequenza in questo formato:

>NOME
aaabbbcccdddsequenza

Può essere amminoacidica o nucleotidica.

Se vai su PDB, c'è la scheda "sequence" e puoi scaricare la fasta.

Poi basta che cerchi su google blast, la inserisci e la cerchi.......

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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